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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 本文研究目的:运用甲基化特异性PCR方法检测肝细胞癌组织及癌旁组织中OPCML、p15、SOCS-1、GST-p、RAR-b、p16、p73、p14、MGMT并口hMLH1基因的甲基化状况,旨在探讨肝癌中是否也存在CpG岛甲基化表型,以及CpG岛甲基化表型和OPCML基因与肝癌的发生和... 展开 本文研究目的:运用甲基化特异性PCR方法检测肝细胞癌组织及癌旁组织中OPCML、p15、SOCS-1、GST-p、RAR-b、p16、p73、p14、MGMT并口hMLH1基因的甲基化状况,旨在探讨肝癌中是否也存在CpG岛甲基化表型,以及CpG岛甲基化表型和OPCML基因与肝癌的发生和预后是否有关。 材料收集:1998年11月~2003年11月年中山大学肿瘤防治中心肝胆外科手术切除的标本。其中合并门静脉主干或一级分支癌栓的病例23例,并随机选择同期未合并门静脉主干或一级分支癌栓的病例27例,共50例肿瘤样本,相应的癌旁组织48例。 研究方法: 1.本研究利用甲基化特异性PCR(MS-PCR)技术检测肝癌及其癌旁组织中OPCML,MGMT,RAR-b,hMLH1,GST-p,p14,p15,p16,p73,SOCS-1等10个基因的甲基化情况。 DNA亚硫酸修饰:按照Herman(10)介绍的方法进行DNA亚硫酸修饰。2μgDNA溶于50μl水中,加入NaOH(终末浓度为0.2mol/L),37℃变性10min;然后加入30μl10mmol/L的氢醌和520μl3mol/L的亚硫酸氢钠(pH5.0),混匀后加矿物油于50C孵育16h。应用WizardDNA纯化柱纯化修饰DNA;纯化后的DNA再用NaOH(终末浓度未0.3mol/L)于室温下处理5min,乙醇沉淀,回收沉淀的DNA溶于50μl水中-80℃储存备用。每轮PCR反应需2μl修饰的DNA做模板。 MSP:特异性CpG甲基化状态运用MSP方法(DNA经过亚硫酸修饰,设计特异性扩增甲基化和非甲基化DNA序列的引物)来检测。亚硫酸处理DNA,能使所有的未甲基化胞嘧啶转变成尿嘧啶,甲基化的胞嘧啶(5-甲基胞嘧啶)因对此处理无效而仍为胞嘧啶。因此,经过处理以后,甲基化与非甲基化的DNA具有不同的序列。从而根据甲基化和非甲基化DNA单链序列的差异来设计不同的PCR引物。通过PCR扩增甲基化或非甲基化DNA单链及对PCR产物进行琼脂糖电泳即可以判断所取标本的基因甲基化状态。p14,p15,p16,p73,MGMT,OPCML,SOCS-1,RAR-b,GST-pandhMLH1的甲基化状态运用MSP(10)方法来检测。 2.病例入选标准:1998年-2003年我院肝胆科手术切除标本;由我院病理确诊为HCC病例;随访资料完整; 3.实验分组:肝癌组50例(癌栓组23例,无癌栓组27例),对应癌旁肿瘤组织:48例 研究结果:肝癌组织甲基化率普遍比相应癌旁组织甲基化率高:OPCML(70.0%vs64.6%)、p15(58.0%vs50.0%)、SOCS-1(78.0%vs50.0%)、GST-p(56.0%vs27.1%)、RAR-b(30.0%vs6.3%)、p16(26.0%vs14.6%)、p73(16.0%vs0%)、p14(36.0vs27.1%)、MGMT(16.0%vs10.4%)和hMLH1(18.0%vs4.2%)。SOCS-1,GST-p,RAR-b,p16和p73基因甲基化率在肝癌组与癌旁组差异有显著性(P<0.05),其它基因两组之间的甲基化率差异无显著性。CIMP阳性组(同时具有≥3个位点甲基化)复发时间较早,一年无瘤生存率为18.2%,而CIMP阴性组(具有≤2个位点甲基化)复发时间较晚,一年无瘤生存率为75.0%(P<0.05)。p15、p73、hMLH1、MGMT、RAR-b、GST-p、SOCS-1基因在癌栓组中的甲基化率比无癌栓组高,但未发现具有统计学意义(P>0.05)。 研究结论:肝癌中也存在着CpG岛甲基化表型(CIMP),CIMP可作为肝癌患者预后判断的指标之一;OPCML基因甲基化可能在肝癌的发生中发挥着重要的作用。 收起
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