中国科学技术信息研究所--国家工程技术数字图书馆

[学位论文] 黄方中国科学院遥感应用研究所 2008年博士导师: 刘定生共167页

摘要 : 自地理信息系统(Geographic Information System，GIS)问世以来，它伴随着IT(Information Technology)等技术的迅速发展而得到长足和全方位的进步。GIS应用不仅局限于地学领域，还扩展到其他多个领域。然而，随着其应用领域不断扩展，GIS逐渐面临如何... 展开自地理信息系统(Geographic Information System，GIS)问世以来，它伴随着IT(Information Technology)等技术的迅速发展而得到长足和全方位的进步。GIS应用不仅局限于地学领域，还扩展到其他多个领域。然而，随着其应用领域不断扩展，GIS逐渐面临如何为这些应用提供高性能的存储、获取以及计算处理能力的问题。这些应用主要包括：(1)诸如数据挖掘，知识发现，多维态、多时相动态GIS；(2)诸如飞行模拟、虚拟地理环境(VGE)等需要GIS快速提供实际地形的可视化类应用；(3)对时间要求非常苛刻的应用，如应急服务决策、实时军事指挥等；(4)WebGIS高性能服务应用(由于网络、服务器性能以及提供GIS服务软件本身的限制，WebGIS在应对大量并发用户访问、大数据量GIS算法处理等复杂情况，其服务性能往往不尽人意)。上述应用往往存在海量数据处理、复杂的分析模型以及实时等需求，从而造成处理过程中高密集的计算和I/O操作(intensive computation and I/O intensive)。由于计算机硬件本身性能不可能无限提升，并且这类GIS应用会随着GIS应用领域的不断扩展而变得更为突出。传统GIS由于其计算平台、体系结构等局限，使得GIS应用面临严峻的计算性能瓶颈问题。随着并行计算技术的不断成熟，它也被应用到地学计算领域。针对上述问题，结合并行计算技术的并行GIS(parallel GIS)算法或高性能GIS(high performanceGIS)服务的相关研究应运而生。这类研究主要集中在利用高性能计算手段，如并行计算技术来解决这类GIS应用中的高密集计算量问题，从而达到处理功能或服务的高效性。然而已有研究往往囿于少数具体的并行GIS算法之上，并未探讨结合具体的GIS软件如何在高性能计算平台上实现整体并行的相关理论与技术方法，以及利用并行GIS软件提供高性能GIS服务的相关研究。这是本文研究的初始动力与主要目的。可见，如何赋予GIS高性能的计算处理能力，并能提供高性能的GIS服务，不仅是GIS发展面临的问题，也是高性能地学计算领域比较关注的问题。显然，这些挑战需要我们以一种有别于传统研究的途径展开，以克服传统并行GIS研究的局限性。目前并行计算实现的主要手段，是采用基于集群系统(cluster)的硬件系统和MPI软件开发包相结合的模式。考虑到可实现性因素，本文采用将开源GIS软件运行在cluster上，并对该软件各类典型GIS算法实现并行的方案。为此，本文提出基于cluster的并行GIS系统这一概念，即将基于cluster的并行计算手段运用到具体的GIS软件环境中，力图解决GIS应用中的高密集计算问题。借助具体的开源GIS软件--GRASS GIS，按照上述方案展开研究，主要内容如下： 1)由于并行GIS与传统GIS的计算平台的不同，从而造成其计算模式也发生改变，并对其体系结构以及数据结构产生影响。为此，本文探讨基于cluster的并行GIS的计算模式(PGCM)、体系结构以及与之适应的并行GIS数据结构(PGDS)与处理模型等； 2)按照上述并行架构，以GRASS GIS为研究对象，充分利用GRASS GIS的多用户工作环境(MURE)，提出GRASS GIS在cluster上的并行化模式：多用户数据并行模式(MUDPP)、GRASS GIS算法并行模式(GGAPP)以及双重并行模式(DPP)。这些并行构建模式可以将不同类型的GIS算法分类并行化，取得比传统GIS算法较高的加速比(Speed-up)和较好的效率(Efficiency)，从而形成GRASS GIS的并行功能模块； 3)结合已有GRASS GIS框架，对各类模块重新整合，以形成可以兼容串行/并行运行方式的软件框架(PGSF)，从而初步实现一个基于cluster的并行GIS原型系统； 4)针对SIG中高性能GIS服务需求，利用上述并行GIS算法模块，探讨如何实现高性能GIS服务的技术途径。收起

关键词 : 并行计算空间信息网格地理信息系统原型系统海量数据处理

2. 磺化聚醚砜及其对灭活血浆中乙肝和艾滋病病毒的光敏剂的吸附去除

[学位论文] 黄方四川大学 2000年博士导师: 郑昌琼共120页

摘要 : 该文概述了聚醚砜磺化机理、磺化方法和磺化聚醚砜的应用前景,提出了能工业化的磺化方法和一种分析横化聚醚砚和自由硫酸混合产物的有效方法,对文献资料缺乏的磺化聚醚砜的溶度参数进行了理论估算,同时研制了膜通透功能测试装置,并对磺化聚醚砚中空纤... 展开

关键词 : 磺化聚醚砜非水滴定溶度参数亚甲蓝光敏剂病毒灭活化学吸附

3. 浙江高速隧道半刚性基层沥青路面设计控制指标研究

[学位论文] 黄方重庆交通大学 2019年硕士导师: 陆兆峰;孔令云共110页

摘要 : 我国已成为世界上隧道拥有量最多的国家之一，目前依然没有专门的规范或指南来指导人们进行隧道路面的设计，只能套用公路沥青路面设计规范或城市道路设计规范。人们对一般路基段半刚性基层沥青路面的研究较多，但对隧道内半刚性基层沥青路面的研究较... 展开我国已成为世界上隧道拥有量最多的国家之一，目前依然没有专门的规范或指南来指导人们进行隧道路面的设计，只能套用公路沥青路面设计规范或城市道路设计规范。人们对一般路基段半刚性基层沥青路面的研究较多，但对隧道内半刚性基层沥青路面的研究较少。对此，本文通过对比分析路面半刚性基层在无横向裂缝和有横向贯通裂缝下以及路面结构在对称荷载和偏荷载作用下的力学响应和疲劳寿命，应用ABAQUS软件建立基层有横向贯通裂缝的隧道半刚性基层沥青路面三维有限元模型;施加偏荷载条件下，分析了仅垂直荷载作用下及水平荷载和垂直荷载共同作用下路面结构的力学响应及其影响因素;通过对比隧道内与一般路基段半刚性基层沥青路面力学响应，结合《公路沥青路面设计规范》(JTG D50-2017)，提出了隧道内半刚性基层（预设横向贯通裂缝）沥青路面设计控制指标。本文主要结论如下: (1)提出沥青层最大拉应变为疲劳破坏控制指标，其力学响应为沿行车方向拉应变;保持规范建议的沥青混合料层永久变形量指标，其力学响应为竖向压应力;提出沥青层最大剪应力为剪切破坏控制指标，其力学响应为剪应力;基层层底拉应力非控制性指标。 (2)沿行车方向拉应变的最不利横向位置应取轮胎正下方（A点），在竖向位置上不应取沥青层底，而应根据具体结构组合进行具体确定。沿行车方向拉应变最大值及其出现深度位置的影响因素敏感性排序:沥青层厚度＞沥青层模量＞基层模量≈基层厚度。 (3)仅垂直荷载作用下，剪应力（S12及S23）最大值的竖向位置位于面层内而非层底，横向位置位于轮胎边缘处。水平荷载和垂直荷载共同作用下剪应力(S23)最大值位于面层项部，剪应力(S12)最大值位于面层内，其值影响因素敏感性排序:沥青层厚度＞基层模量≈沥青层模量＞基层厚度。 (4)仅垂直荷载作用下各结构的剪切型应力强度因子(KⅡ)均大于张开型应力强度因子(KⅠ);而在水平荷载和垂直荷载共同作用下各结构的张开型应力强度因子(KⅠ)均大于剪切型应力强度因子(KⅡ)。 (5)由于沥青层内最大拉应变显著大于沥青层底拉应变，从而导致沥青层内的疲劳寿命远小于沥青层底的疲劳寿命。沥青层疲劳开裂寿命影响因素敏感性排序:基层模量＞面层模量≈面层厚度＞基层厚度。基层模量越大、基层厚度越厚、沥青面层模量越小对沥青面层疲劳开裂寿命越有利。 (6)应用MATLAB软件基于BP神经网络原理，建立了控制指标与结构参数及材料参数的关系模型。收起

关键词 : 公路隧道路面设计半刚性基层力学响应

4. 恶劣地质条件下小间距隧道施工的数值模拟

[学位论文] 黄方武汉理工大学 2008年硕士导师: 李之达共105页

摘要 : 我国地形、地质条件复杂，山岭区所占比重极大，高等级公路建设中大量地遇到隧道工程，由于特殊地质及地形条件的限制，隧道间距一般都难以满足普通技术规范要求，因此需要采用小净距隧道及连拱隧道等特殊结构型式。本文从隧道围岩压力入手介绍... 展开我国地形、地质条件复杂，山岭区所占比重极大，高等级公路建设中大量地遇到隧道工程，由于特殊地质及地形条件的限制，隧道间距一般都难以满足普通技术规范要求，因此需要采用小净距隧道及连拱隧道等特殊结构型式。本文从隧道围岩压力入手介绍了围岩的初始应力状态以及围岩松动压力的确定方法并介绍了围岩的破坏模式及其影响因素通过对支护结构与围岩相互作用的力学分析，建立了围岩与支护结构平衡状态。再根据隧道工程的受力特点并对隧道施工过程中洞室稳定性与支护结构相互作用机理的深入分析，建立了隧道施工过程的计算模型然后采用弹塑性有限元方法，对隧洞开挖与支护进行模拟，通过对支护进行结构分析，来分析隧道支护的力学性能。论文以九岭隧道施工过程中的量测设计及实施为基础，在现场实测的基础上，采用大型有限元程序ANSYS，对隧道施工过程、围岩应力场、位移场以及近距隧道施工相互影响等进行模拟研究，所得结论与现场数据拟合良好。对于双层衬砌结构作用的模拟，本文提出了三种接合面相互作用模型，并对其中两种进行了数值模拟，一种是用梁单元模拟二次衬砌，一种是用板单元模拟二次衬砌。通过分析并进行对比得出了一些有益的结论。在对隧道进行开挖和支护过程的模拟中，ANSYS是通过杀死和激活单元来模拟材料的消去和添加。利用单元的这种生死功能，可以简单有效地模拟隧道的开挖和支护过程。但要注意的是在激活和杀死单元时，自由度的控制。论文主要进行了Ⅳ级围岩两种模型开挖过程的数值分析，并分别比较了初期支护的最大弯矩值、初期支护的最大轴力值、锚杆的最大轴力值、左洞顶节点位移值、最大等效应力值随开挖过程的变化规律。同时还进行了Ⅴ级围岩开挖过程的数值模拟，为恶劣地质条件下隧道的施工提供了一些参考。最后本文讨论了在不同埋深下Ⅳ级围岩的各项参数的变化情况，通过数据和曲线图的变化规律得出了各项研究变量与埋置深度之间基本为线性关系变化的结论，为埋深对隧道施工过程中各个参数的影响起到了定性分析的作用。收起

关键词 : 隧道工程隧道施工隧道围岩支护结构数值模拟

5. 鄂尔多斯盆地深部热结构特征及其对华北克拉通破坏的启示

[学位论文] 黄方中国科学院大学 2014年博士导师: 何丽娟共102页

摘要 : 华北克拉通破坏一直是国际热点研究问题，但关于华北克拉通减薄机制一直争论不休，且来自地热学的研究和贡献相对较少。位于华北克拉通西部的鄂尔多斯盆地，为一典型的板内构造单元，发育了古生代以来不同时期的稳定沉积。侏罗纪至白垩纪是鄂尔多斯盆... 展开华北克拉通破坏一直是国际热点研究问题，但关于华北克拉通减薄机制一直争论不休，且来自地热学的研究和贡献相对较少。位于华北克拉通西部的鄂尔多斯盆地，为一典型的板内构造单元，发育了古生代以来不同时期的稳定沉积。侏罗纪至白垩纪是鄂尔多斯盆地的形成、演化的重要活动期，且其形成是受特提斯构造域和环太平洋构造域联合作用的结果。本文主要从大地热流、岩石圈热结构及地球动力学方向着手，通过模拟研究东西向横穿鄂尔多斯盆地的二维剖面深部温度场及其深部热-流变结构特征，与华北克拉通破坏研究相结合，揭示其深部地球动力学机制，试图为华北克拉通破坏提供地热学证据和启示。本文作者收集、归纳和整理了大量已发表的大地热流数据，经过最新系统整理和汇编，最新统计数据已达1098个，是截至2012年以来最全面最系统的一次大地热流数据汇编。此汇编工作对地热学及其他相关地学研究具有一定贡献和理论意义。作者根据最新1062个大地热流数据（去除36个D类后）进行统计分析，热流值变化范围为:26.2-140mW/m2，平均为60.2±15mW/m2，较历次汇编的平均值有降低，其原因是早期热流数据主要集中在热流较高的东部地区，而近些年西北低热流地区的数据已显著增加。鄂尔多斯盆地现今大地热流数据54个（去除D类后），变化范围为:34.8-84.2mW/m2，平均值为61.6±9.3mW/m2。这些基础热流数据是后续岩石圈热结构和流变学结构研究的基础。本研究基于二维稳态热传导方程，选取东西向横穿鄂尔多斯盆地地质与地球物理解释大剖面进行了深部温度场数值模拟研究，得到了鄂尔多斯盆地下伏岩石圈热结构特征，进而得到其流变学特征。鄂尔多斯盆地各构造单元深部的地幔热流变化范围:21.2～24.5mW/m2，且体现为鄂尔多斯盆地东部地幔热流较高，西部相对较低，但地幔热流整体平缓且不高的特征，与华北东部相比明显偏低，表明华北克拉通西部较为稳定的深部热背景。在对其热结构研究过程中，重点对能反映深部区域热背景和深部动力学环境的地幔热流进行了探讨，并与中国大陆东西部进行了对比研究，其相对地表热流而言，对揭示华北克拉通破坏研究更有意义。剖面的壳幔热流比(Qc/Qm)介于1.51-1.84之间，为“热壳冷幔”型热状况，表明来自浅部地壳的热贡献作用较大，而来自鄂尔多斯盆地深部的地幔热流贡献较少，深部处于相对比较稳定的构造环境。该热状态与华北东部的“冷壳热幔”型不同。对于鄂尔多斯盆地东部地表热流较高的原因，地壳热流对地表热流的贡献作用相对较大。东西部的差异抬升剥蚀作用是造成东部热流较高的另一原因。鄂尔多斯盆地自西向东的各构造单元的流变学特征几乎均表现为“果冻三明治”结构且地幔强度较大的稳定大陆岩石圈结构特征。对比华北克拉通东、西部热流变结构，表明二者差异很大，从地热学角度也进一步补充说明华北克拉通西部处于相对稳定的构造动力学环境。通过岩石圈热结构的研究，进一步丰富了热岩石圈厚度研究内涵。且重点对克拉通地震岩石圈与热岩石圈厚度差异进行了对比。研究表明，鄂尔多斯盆地东部热岩石圈厚度底界平均为140km，西部的底界厚度平均为160km。鄂尔多斯盆地西部地震岩石圈与热岩石圈厚度差异达到约140km，鄂尔多斯东部的汾渭地堑，渤海湾盆地二者差异逐渐减小。即华北克拉通自西向东，地震岩石圈厚度与热岩石圈厚度差异不断减小。综合前人地质、地球化学、地球物理以及本文地热学相关研究表明，鄂尔多斯盆地处于相对稳定的深部地幔环境、“果冻三明治”的稳定大陆岩石圈流变结构、正常偏厚的岩石圈厚度，华北克拉通自西向东地震岩石圈厚度与热岩石圈厚度差异的减小，进一步强调华北克拉通的破坏主要集中在华北克拉通东部或中部，华北克拉通西部的鄂尔多斯盆地西部相对稳定。华北克拉通自西向东，地震岩石圈厚度与热岩石圈厚度差异不断减小，意味着华北克拉通岩石圈下部的软流圈地幔粘性系数自西向东逐渐降低，印证了太平洋俯冲脱水作用对华北克拉通的影响。综合前人成果及本文研究，作者对华北克拉通减薄机制进行了思考:作者倾向认为，太平洋俯冲作用下华北克拉通东部形成的大地幔楔中对流热侵蚀和橄榄岩熔融相互作用是华北克拉通减薄破坏的动力学机制。收起

关键词 : 大地热流岩石圈热结构华北克拉通减薄破坏动力学机制鄂尔多斯盆地

6. 亚硒酸钠在结肠癌细胞中诱导氧化还原依赖的Bax激活与细胞凋亡的研究

[学位论文] 黄方北京协和医学院(中国医学科学院) 2009年博士导师: 许彩民;陈佺共102页

摘要 : 很多证据表明硒化合物具有抑制肿瘤发生的化学预防作用，最近研究表明硒化合物可能具有成为化疗药物用于肿瘤治疗的潜能，在一定剂量范围内对肿瘤细胞具有一定的选择性抑制生长和诱导凋亡的作用而正常细胞耐受较好。结肠癌是一种常见的恶性肿瘤，在我... 展开很多证据表明硒化合物具有抑制肿瘤发生的化学预防作用，最近研究表明硒化合物可能具有成为化疗药物用于肿瘤治疗的潜能，在一定剂量范围内对肿瘤细胞具有一定的选择性抑制生长和诱导凋亡的作用而正常细胞耐受较好。结肠癌是一种常见的恶性肿瘤，在我国的发病率呈上升趋势，本文利用多种体外培养的结肠癌细胞系和裸鼠结肠癌移植瘤模型证明超营养剂量的亚硒酸钠在体内体外均能诱导细胞凋亡。亚硒酸钠诱导细胞凋亡的机理目前仍不很清楚，本文研究了Bcl—2家族蛋白在亚硒酸钠诱导凋亡过程中发挥的作用，并进一步分析了亚硒酸钠诱导Bax激活的分子机制。通过多种细胞凋亡检测技术，在SW480、HCT116、HT29三种结肠癌细胞系中证明5—10μM亚硒酸钠能诱导典型细胞凋亡，并诱发细胞色素C从线粒体释放至胞浆，说明内源性线粒体凋亡通路被激活。Bcl—2家族蛋白是重要的细胞凋亡调节因子，其与线粒体凋亡通路具有密切联系，在SW480细胞凋亡的研究中发现亚硒酸钠能诱导Bax从胞浆转位至线粒体，本文主要研究Bax这个关键分子在亚硒酸钠诱导细胞凋亡中的作用。将GFP标记的Bax在SW480细胞中稳定表达，构建了可实时观察Bax功能状态变化的细胞模型。利用这个模型，进一步发现亚硒酸钠诱导了Bax构象变化、迁移至线粒体、多聚体形成和细胞色素C释放这一系列事件，并明确了这些事件的先后顺序。在此体系中高表达抗凋亡Bcl—2家族成员Bcl—xL能显著抑制亚硒酸钠诱导的Bax构象变化、迁移至线粒体、多聚体形成和细胞色素C释放。在明确亚硒酸钠激活Bax这一现象之后，利用基因缺失的细胞模型分析了Bax对于亚硒酸钠诱导细胞凋亡的重要性。Bax/Bak双缺失的MEF细胞与野生型MEF细胞相比对亚硒酸钠诱导的细胞死亡具有很强抗性，Bax单缺失的HCT116结肠癌细胞与野生型HCT116细胞相比对亚硒酸钠诱导的细胞死亡敏感性降低，说明Bax是亚硒酸钠诱导细胞死亡的重要介导分子。本文进一步分析了亚硒酸钠诱导Bax激活的分子机制，发现在SW480细胞中亚硒酸钠能诱导细胞内ROS水平持续性升高。在稳定表达GFP—Bax的SW480细胞中，MnSOD活性类似物MnTMPyP能抑制亚硒酸钠诱导的Bax激活，而GSH前体NAC和GSH耗竭剂BSO两种化合物在促进亚硒酸钠诱导的ROS水平升高的同时也促进Bax激活。在寻找亚硒酸钠诱导Bax激活的线索过程中，发现通过氧化应激使Bim表达上调可能是Bax激活的机制之一。除此之外，进一步利用Biotin标记的巯基修饰剂检测Bax氧化还原状态发现，亚硒酸钠在SW480细胞中能诱导Bax自由巯基氧化，而MnTMPyP能抑制Bax巯基氧化。这些现象提示亚硒酸钠可能通过内源性ROS直接改变Bax的氧化还原状态，其中半胱氨酸的修饰可能发挥了关键作用。利用定点突变技术，构建了Bax序列上两个保守半胱氨酸位点突变的表达载体（C62/126SGFP—Bax），并与野生型GFP—Bax—样在SW480细胞中稳定表达，实时比较野生型和突变体Bax对亚硒酸钠反应的差别。62/126位半胱氨酸突变抑制了亚硒酸钠和H2O2诱导的Bax构象变化、迁移至线粒体、多聚体形成和细胞色素C释放，但不能抑制DNA拓扑酶抑制剂Etoposide和Camptothecin诱导的Bax激活和细胞色素C释放。这些结果提示亚硒酸钠可能通过内源性ROS介导改变62/126位半胱氨酸的氧化还原状态，诱导Bax构象变化而使其激活。 5—10μM亚硒酸钠在体外虽能显著诱导结肠癌细胞凋亡，但对原代培养的人胚胎肠粘膜上皮细胞凋亡诱导作用较弱。进一步建立了结肠癌动物模型，在整体动物水平观察亚硒酸钠对结肠癌的作用。将SW480细胞接种至裸鼠背部构建结肠癌移植瘤模型，并用亚硒酸钠处理后发现2mg/kg/d的亚硒酸钠能抑制结肠癌移植瘤生长，而对小鼠体重及一般情况影响不大；TUNNEL法检出亚硒酸钠处理组细胞凋亡水平高于对照组；提示超营养剂量的亚硒酸钠在体内情况下可能具有选择性杀伤肿瘤细胞的能力。综上所述，细胞凋亡不仅是解释亚硒酸钠化学预防作用的重要机制，也为其在结肠癌化学治疗的应用可能性上提供了初步的依据。收起

关键词 : 结肠癌 Bax激活细胞凋亡亚硒酸钠氧化还原化学治疗

7. 薄壁杆件约束有限条法的拓展及其应用研究

[学位论文] 黄方重庆大学 2021年硕士导师: 金声共100页

摘要 : 薄壁构件力学特性与实体截面杆件有所不同，其失稳问题复杂而多变。薄壁杆件的基本屈曲模态可分为整体屈曲、局部屈曲和畸变屈曲，有时剪切和横向伸缩变形亦不可忽略。薄壁构件不同模式失稳的屈曲机理差异显著，而缺陷、屈曲后、材料弹塑性等因素对不... 展开

关键词 : 薄壁构件约束有限条法 Bredt剪力流屈曲模态畸变模式

8. 光复后到1970年代中期台湾住宅若干案例研究

[学位论文] 黄方南京大学 2011年硕士导师: 吉国华共94页

摘要 : 住宅与社会发展和人民生活密切相关，反思历史、汲取经验和教训对住宅的发展具有重要意义，而两岸在二战后不同的历史走向使其住宅发展走过了不同的历程。本文站在历史发展的角度展开从现存的住宅案例入手研究台湾光复后到1970年代的住宅发展历程，文... 展开

关键词 : 日遗房舍住宅区台湾地区住宅类型

9. 大别造山带碰撞后岩浆岩地球化学：壳幔相互作用和深部过程

[学位论文] 黄方中国科学技术大学 2002年硕士导师: 李曙光共91页

摘要 : 大别山造山带发育了大量的碰撞后岩浆岩,包括了从超基性-基性-中性-酸性整个岩浆演化系列,其源区深度从上地幔一直到中下地壳.该文对这些岩浆岩进行了详细的地球化学研究,讨论了大别造山带碰撞后岩浆作用及其深部过程.此外,针对过去文献中存在对北大别... 展开

关键词 : 大别山造山带岩浆岩地球化学

10. HIV-1限制因子的生化活性及HIV-1调控蛋白Vpr抑制NF-κB信号通路机制的研究

[学位论文] 黄方中国科学院研究生院 2013年博士导师: 杨荣阁共90页

摘要 : TRIM62，又名DEAR1，是TRIM/RBCC家族的一员，此家族的成员都含有保守的RING，B-box和Coiled-coil结构域。正是由于该家族的许多成员在N端具有RING结构域，而此结构域能够介导E3泛素连接酶活性，所以很多TRIM/RBCC家族的成员都是E3泛素连接酶[1，2]。... 展开 TRIM62，又名DEAR1，是TRIM/RBCC家族的一员，此家族的成员都含有保守的RING，B-box和Coiled-coil结构域。正是由于该家族的许多成员在N端具有RING结构域，而此结构域能够介导E3泛素连接酶活性，所以很多TRIM/RBCC家族的成员都是E3泛素连接酶[1，2]。现有的很多报道已经证实了此家族的成员在细胞增殖和分化、细胞凋亡、肿瘤形成和细胞抗病毒反应等过程中起到重要的作用[1，2，3，4，5]。尽管现有对TRIM62的研究已经证实它在乳腺癌、逆转录病毒的复制和先天性免疫反应等过程中有重要的作用，但对其具体的生物学功能和在细胞中的定位还没有明确地研究和报道[5，6，7]。在本文中，证实了TRIM62蛋白的E3泛素连接酶活性并确定其在细胞中的定位。TRIM62蛋白，在E2酶UbcH5b的协同作用下，在体外无细胞系统中可以催化自身的泛素化过程，且此过程需要其完整的RING结构域。另外，在真核HEK293T细胞中再次确认了TRIM62蛋白的E3泛素酶活性也是依赖其RING结构域;进一步发现在293T细胞中加入蛋白酶体抑制剂MG132可以稳定泛素化的TRIM62，这说明自泛素化的TRIM62在细胞内会被降解。在此基础上，发现TRIM62蛋白以及它的两个突变体在293T和Hela两种细胞系中都定位在细胞质中。综上所述，实验结果显示，定位在细胞质中的TRIM62蛋白，是一种依赖其RING结构域的E3泛素连接酶，并且在无细胞系统和真核细胞内都可以催化其自身泛素化。 Vpr（病毒蛋白R）是由HIV-1病毒基因组编码的一种具有多种功能的调控蛋白，其由96个氨基酸组成，分子量大小为14 kDa[8，9]。Vpr蛋白可以结合Gag蛋白的p6结构域从而被包装入成熟的病毒颗粒[10，11]。Vpr蛋白除了能够促进HIV-1病毒在宿主细胞内的复制之外，它还可以诱导细胞凋亡、扰乱细胞有丝分裂以及诱导细胞发生G2期阻滞(G2 arrest)[12，13，14，15，16]。有研究发现，Vpr蛋白可以结合不同的细胞因子，如:Sp1、TFⅡB、p300/CBP和HSP70等，并作为一种转录因子参与到细胞炎症反应、免疫反应和细胞增殖等过程[8，17，18，19，20，21，22]。近年来发现Vpr蛋白参与调控NF-κB信号通路，但其具体作用机制仍存在争议。有研究发现，Vpr在U937细胞系中可以激活NF-κB信号通路[23]，但Vpr在HIV-1病毒感染的U1细胞系中却对TNFα激活的NF-κB信号通路有抑制作用[24]。最近的一篇报道证实了Vpr可以增强IKKα/β的磷酸化水平而激活NF-κB信号通路的经典途径和非经典途径[25]。在本文中，首先在HEK293细胞系中确认了Vpr可以明显抑制由TNFα激活的NF-κB信号通路，同时，也发现了Vpr可以抑制由IL-1β或者TRAF6激活的NF-κB信号通路。在此基础上，发现了Vpr蛋白可以降解TRAF6同时抑制TRAF6的K63位自泛素化，但Vpr的点突变体Q65R相对于野生型Vpr蛋白对降解和抑制作用有一定的回复。另外，也检测了在Vpr存在的情况下，TRAF6蛋白的几种下游关键因子的蛋白水平变化情况。结果显示:Vpr可能是通过降解TRAF6蛋白和抑制TRAF6蛋白的K63位自泛素化进而可以抑制由IL-1β或者TRAF6激活的NF-κB信号通路。 SAMHD1最初是作为一种由干扰素γ诱导的基因从树突状细胞中克隆得到，与鼠的Mg11基因同源[26]。SAMHD1蛋白作为一种干扰素反应的负调控因子，同人的先天性免疫疾病AGS(Aicardi-Goutières syndrome)相关[27，28]。SAMHD1蛋白含有SAM结构域和HD结构域，SAM结构域介导蛋白与蛋白或蛋白与RNA之间的相互作用，而HD)结构域含有大量保守的氨基酸残基:组氨酸H和天冬氨酸D，且具有核酸酶和磷酸水解酶活性[29，30]。2011年，SAMHD1首次在巨噬细胞和树突状细胞中被证实为一种新型的抗HIV-1病毒因子，其特异性地抑制HIV-1病毒的逆转录过程，而HIV-2/SIVsm编码的Vpx蛋白可以通过泛素化-蛋白酶体途径降解SAMHD1，进而增强HIV-1在这两种细胞中的感染能力[31，32，33，34]。而后，SAMHD1被证实能大幅降低细胞中dNTPs的水平从而使HIV-1病毒的逆转录过程不能有效的进行从而达到抑制病毒复制的目的[35，36，37]。但目前对SAMHD1的研究并没有详细地解析出其抑制HIV-1病毒复制的机制。在本文中，发现了SAMHD1在Hela细胞系中可以抑制HIV-1假病毒pNL4-3，luc的复制，但在HEK293T细胞中却对病毒没有影响。而后试图寻找这两种细胞系中与SAMHD1蛋白存在直接或间接相互作用的未知蛋白，通过免疫沉淀和银染的方法将两种细胞系在未受病毒感染和病毒感染条件下存在差异的蛋白回收并送样进行质谱分析，从而鉴定筛选出来的蛋白种类。总的来说，希望通过筛选得到与SAMHD1蛋白存在相互作用的蛋白种类，进而解析出SAMHD1抑制病毒复制的具体机制，同时也希望能解释其在HEK293T细胞中不能行使其抑制病毒复制功能的原因。收起

关键词 : 信号通路生化活性基因组编码免疫反应细胞增殖