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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 目的与背景:有研究表明VEGF基因单核苷酸多态性(SNP)与多种自身免疫性疾病存在相关性。但是少有针对VEGF基因的启动子rs699947与内含子rs10434和rs833070与神经精神狼疮(NPSLE)遗传易感性的研究报道。本研究拟探讨VEGF基因rs699947、rs10434、rs83307... 展开 目的与背景:有研究表明VEGF基因单核苷酸多态性(SNP)与多种自身免疫性疾病存在相关性。但是少有针对VEGF基因的启动子rs699947与内含子rs10434和rs833070与神经精神狼疮(NPSLE)遗传易感性的研究报道。本研究拟探讨VEGF基因rs699947、rs10434、rs833070位点单核苷酸多态性与NPSLE遗传易感性的关系。 方法:本课题收集在广西医科大学第一附属医院及广西自治区人民医院十年内住院治疗的患者标本,选取经《系统性红斑狼疮分类标准(1999年版)》确诊为神经精神狼疮且无其他自身免疫病的患者为NPSLE组(阳性组),确诊为系统性红斑狼疮但无精神神经症状的患者为non-NPSLE组(阳性对照组),再按与阳性对照组年龄匹配相近原则随机选取同期在广西自治区人民医院体检中心的健康体检者作为健康对照组(阴性对照组),共收集到NPSLE组82例、non-NPSLE组166例和阴性对照组150例。样本进行DNA提取纯化后,用Snapshot测序法对三个SNP位点的等位基因及基因型进行分析,同时,用一代普通测序法(Sanger)对所测结果进行验证,计算并统计等位基因和基因型的分布频率。统计学采用拟合优度x2检验对三个所选基因位点进行哈-温平衡(Hardy-weinbergequilibrium,HWE)检验,用卡方检验分析实验标本的基因型和等位基因分布频率在各组之间的统计学差异。采用二元Logistic回归对年龄校正后,计算P值、比值比(Oddsratio,OR)和95%可信区间(Confidentialinterval,CI),分析实验所选位点的NPSLE与non-NPSLE患病风险的相关性。运用在线软件SHEsis构建VEGF基因三个位点的单倍体模型,筛选出与NPSLE遗传易感性相关的单倍型。 结果:1.VEGF基因rs699947、rs10434的基因型在NPSLE组、non-NPSLE组及阴性对照组中分布不符合Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),可能与样本量偏小及抽样误差有关,应进一步扩大样本量进行研究;rs833070的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),说明该位点的检测样本均具有可比性及群体代表性。 2.rs10434位点的GG、GA和AA三种基因型基因型频率在NPSLE组、non-NPSLE组和阴性对照组中有统计学意义(P<0.05)。 3.rs699947和rs833070位点的基因型和等位基因频率在NPSLE组、non-NPSLE组和阴性对照组分布频率均无统计学意义(P>0.05)。 4.利用Logistic回归分析对性别因素进行校正后,分析VEGF基因杂合模型、纯合模型、等位基因模型、显性模型和隐性模型五个模型与神经精神狼疮患病风险的相关性。 在rs10434位点,以GG基因型和G基因为参照,A等位基因、突变杂合子模型GA、显性模型(GA+AA)与NPSLE患病风险存在相关性(P<0.05)。A等位基因、显性模型(GA+AA)与non-NPSLE的患病风险存在相关性(P<0.05)。以non-NPSLE组为参照,基因型GA、显性模型(GA+AA)与NPSLE的发病风险有相关性(P<0.05)。 5.在性别分层中,与non-NPSLE组相比,rs699947位点的隐性模型CC与男性non-NPSLE患病有相关性(P<0.05);隐性模型CC与女性NPSLE患病风险有相关性(P<0.05)。rs10434位点的基因型GA、AA、等位基因A及显性模型(GA+AA)与男性non-NPSLE的患病风险有关(P<0.05);基因型GA、显性模型(GA+AA)及等位基因A与女性NPSLE及non-NPSLE的患病风险均有相关性(P<0.05)。以non-NPSLE为对照,基因型GA及显性模型(GA+AA)与女性NPSLE患病风险有相关性(P<0.05)。 6.通过SHEsis软件对VEGF基因三个位点的基因多态性进行单倍体构建,结果显示,单倍型AAA、AGG与AGA可以增加NPSLE患病风险(P<0.05),其余单倍体型与NPSLE的患病风险无关(P>0.05);单倍型AAG、CAG与CGG可以增加non-NPSLE患病风险(P<0.05)。 结论:1、VEGFrs833070位点基因多态性与NPSLE、non-NPSLE组的患病风险无明显相关。 2、VEGFrs10434位点的A等位基因、突变杂合子模型GA、显性模型GA+AA可以增加NPSLE的患病风险。A等位基因、显性模型GA+AA可以增加non-NPSLE的患病风险。 3、VEGF基因中rs699947位点的隐性模型CC可以增加女性的患病风险NPSLE,但可减少男性non-NPSLE患病风险。rs10434位点的基因型GA、AA、等位基因A及显性模型(GA+AA)可能增加男性non-NPSLE的患病风险,基因型GA、显性模型(GA+AA)及等位基因A可能增加女性NPSLE及non-NPSLE的患病风险。 4、VEGFrs699947、rs10434、rs833070三个位点构建的AAA、AGG与AGA单倍型可能增加NPSLE的患病风险;AAG、CAG与CGG单倍型可能增加non-NPSLE的患病风险。 收起
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