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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 目的: 探讨SAE1在三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)中的表达情况及其对患者预后的影响。 方法: 通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库及GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载TNBC组织及正... 展开 目的: 探讨SAE1在三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)中的表达情况及其对患者预后的影响。 方法: 通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库及GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载TNBC组织及正常组织信息共558例,再使用R语言软件(http://bioconductor.org/biocLite.R版本3.5.0)对GEO数据集(GSE21653、GSE31448、GSE45827、GSE53752、GSE65216、GSE36295、GSE37751、GSE38959、GSW61724)及TCGA数据库的芯片数据进行质量分析,并将芯片数据进行整理转化和数据处理。 收集2013年6月-2018年5月在福建医科大学附属协和医院手术切除且临床资料完整,诊断明确并存档的原发性TNBC病例207例。收集患者的临床资料,包括年龄、入院时间、手术类型、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、复发或转移时间、死亡时间、死亡原因等。随访截止的时间为2020年12月31日。随访内容为患者肿瘤复发、肿瘤转移情况及患者的总生存期。 应用免疫组织化学染色方法检测TNBC组织中SAE1的表达情况。通过卡方检验、单因素分析以及多因素分析(COX回归分析)明确SAE1、年龄、手术类型、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移等因素对TNBC患者预后的影响。 结果: (1)使用R语言对GEO数据集(GSE21653、GSE31448、GSE45827、GSE53752、GSE65216、GSE36295、GSE37751、GSE38959、GSW61724)及TCGA数据库中共558例TNBC肿瘤组织和289例癌旁乳腺组织进行计算。结果显示相对于配对的非肿瘤乳腺组织,SAE1在TNBC组织中的mRNA水平显著增高。 (2)TNBC组织样本207例,患者年龄27-72岁,中位年龄51岁,年龄≤50岁者93例,>50岁者114例;肿瘤直径≤2cm者86例,>2cm者121例;Ⅰ级+Ⅱ级者77例,Ⅲ级者130例;有脉管瘤栓者134例,无脉管瘤栓者73例;无淋巴结转移者124例,有淋巴结转移者83例;接受全乳切除术者195例,接受保乳手术者12例。随访时间为7-78个月,中位随访时间为50个月。53例(25.6%)出现肿瘤复发或转移,154例(74.4%)未出现肿瘤复发或转移。34例(16.4%)死于乳腺癌。 (3)SAE1表达于肿瘤细胞胞浆,切片总评分为肿瘤细胞染色强度0-3级乘以着色范围1-4分,分为低表达(0-6分)和高表达(7-12)。根据评分结果分为SAE1高表达组(SAE1-H)和SAE1低表达组(SAE1-L)。SAE1-H有78例,SAE1-L有129例。SAE1蛋白在TNBC肿瘤组织中的表达显著高于癌旁组织。在不同的年龄、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、手术方式等分组中,SAE1的表达差异无明显统计学意义(P>0.05)。 (4)单因素回归分析结果显示:年龄、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、SAE1高表达与TNBC患者的无病生存期(Disease free survival,DFS)存在相关性(P<0.05);手术方式与无病生存期(DFS)无明显相关性(P>0.05)。组织学分级、淋巴结转移情况、SAE1高表达与总生存期(Overall survival,OS)存在相关性(P<0.05);年龄、肿瘤大小、脉管瘤栓及手术方式与总生存期(OS)无明显相关性(P>0.05)。 (5)多因素分析结果显示:肿瘤大小、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、SAE1高表达是TNBC患者无病生存期(DFS)的独立影响因素(P均<0.05);组织学分级、淋巴结转移情况、SAE1高表达是TNBC患者总生存期(OS)的独立影响因素(P<0.05)。 结论: (1)TCGA数据库及GEO数据集(GSE21653、GSE31448、GSE45827、GSE53752、GSE65216、GSE36295、GSE37751、GSE38959、GSW61724)中SAE1在TNBC组织中的mRNA水平较正常乳腺组织显著增高。 (2)SAE1蛋白在TNBC肿瘤组织中的表达显著高于癌旁组织。 (3)在不同的年龄、肿瘤大小、组织学分级、脉管瘤栓、淋巴结转移情况、手术方式等分组中,SAE1的表达差异无明显统计学意义(P>0.05)。 (4)SAE1高表达是TNBC患者肿瘤复发或转移及总生存的危险因素。SAE1可以作为TNBC预后评价的一个指标。 收起
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