中国科学技术信息研究所--国家工程技术数字图书馆

[学位论文] 侯玲伟中国科学院大学 2021年博士导师: 蔡磊共353页

摘要 : 亚隔孢壳科真菌（Didymellaceae）隶属于真菌界子囊菌门（Ascomycota）、座囊菌纲（Dothideomycetes）、格孢腔菌目（Pleosporales），其模式属为亚隔孢壳属（Didymella）。该科主要包括壳二孢属（Ascochyta）、亚隔孢壳属、附球孢属（Epicoccum）、茎... 展开亚隔孢壳科真菌（Didymellaceae）隶属于真菌界子囊菌门（Ascomycota）、座囊菌纲（Dothideomycetes）、格孢腔菌目（Pleosporales），其模式属为亚隔孢壳属（Didymella）。该科主要包括壳二孢属（Ascochyta）、亚隔孢壳属、附球孢属（Epicoccum）、茎点霉属（Phoma）等28个属，是世界上物种数目最丰富、地理分布最广泛的真菌类群之一。该科大多数物种为动植物病原菌，其中一些物种被多个国家列入进境检疫名录。长期以来由于种属概念不清晰、寄主相关性的命名方法及其地理分布及宿主范围广泛等原因，造成科内物种数目庞大，目前已报道5400多个物种名称。虽然在前人的研究中，依据分子系统发育分析结合形态学观察，梳理了亚隔孢壳科内属及物种的关系，但是由于该类群真菌形态易受环境影响、大部分物种缺乏佐证鉴定的模式标本、菌株或有效可靠的分子数据等原因，一些属、种的界限及其分类地位仍不明确，使物种鉴定和分类工作十分困难，也给进境植物检疫性有害物种的检测鉴定和相关科研工作带来阻碍。此外该类群缺乏准确、快速和有效的物种鉴定DNA条形码和鉴定体系。为解决上述问题，本研究开展了亚隔孢壳科真菌的分类、系统演化及多样性研究。基于大量的资源调查，通过菌株分离并与国际同行合作，收集到来自世界74个国家，442种宿主植物及土壤、海洋、水、空气、珊瑚和人体等35种其他基质的亚隔孢壳科菌株1100株。通过ITS、LSU、rpb2和tub2单基因及联合多基因系统发育分析，结合形态特征、生理特性、地理分布和寄主范围等信息，采用多相分类学方法，补充和完善了亚隔孢壳科真菌的系统发育骨架树和多基因数据集，探讨了亚隔孢壳科内属和物种的概念并厘清其系统发育关系，澄清了小球壳孢属（Microsphaeropsis）在亚隔孢壳科中的分类地位，修订了Remotididymella、Nothophoma、Chaetasbolisia的属征。本研究获得的亚隔孢壳科菌株分属于36个属，301个物种。研究过程中，描述并建立新属8个（Dimorphoma、Ectodidymella、Longididymella、Macroascochyta、Paramicrosphaeropsis、Pseudope yronellaea、Sclerotiophoma、Vandijckomycella）、新组合21个(Ascochyta astragalina、A.koolunga等）、新名称2个（Heterophoma verbasci-densiflori和Nothophoma nullicana），描述新物种52个（Allophoma alba、Al.anatiae等），恢复4个重要物种名称的使用(Epicoccum mezzettii、E.oryzae、E.purpurascens和Toruloidea tobaica)。此外，为了稳定和规范物种名称在国际分类学、植物病理学等领域中的应用，本研究以相同寄主、相同采集地和相似的形态特征为标准，为12个重要物种指定注释模式和新模式。结合文献和数据库调研，本研究补充和完善了前人研究中缺失的物种信息、分子序列等，提供了一个包含335个物种1256个菌株的多基因数据集，为认识亚隔孢壳科的系统演化规律和开展后续研究奠定了重要基础。进一步的分析结果表明，rpb2基因在亚隔孢壳科内具有较高的种属分辨率，建议将其作为该类群的候选物种鉴定DNA条形码。此外，本研究通过改进PCR扩增体系及反应程序，显著提高了亚隔孢壳科真菌系统发育分析中关键基因rpb2的扩增成功率。基于广泛收集的菌株信息，本研究初步分析了亚隔孢壳科真菌的物种多样性及其与寄主/基质的相关性。结果表明，与豆科(Fabaceae)植物相关的亚隔孢壳科真菌物种多样性最高，其次为禾本科（Poaceae）、菊科(Asteraceae)和蔷薇科(Rosaceae)。在本研究中，亚隔孢壳属和附球孢属物种和菌株数目最多，并且两者的寄主/基质范围最广，表明其在植物和各种环境中具有极强的适应性。尽管大部分亚隔孢壳科真菌的寄主范围均较广泛，壳二孢属表现出对豆科植物一定程度的寄主偏好性。综上，本研究梳理了亚隔孢壳科的分类系统，进一步完善了其系统发育骨架树，澄清了科、属、种界限和系统演化关系，建立起更完整、稳定、可靠且趋于自然演化关系的分类系统，为后续的资源收集、应用研究和降低亚隔孢壳科真菌对我国植物、粮食、食品安全造成的威胁提供理论基础，具有重要实践意义。收起

关键词 : 亚隔孢壳科真菌系统发育分类学物种多样性

2. 中国西南地区亚隔孢壳科(Didymellaceae)植物病原真菌分子系统学研究

[学位论文] 袁军贵州大学 2021年硕士导师: 王勇共98页

摘要 : 亚隔孢壳科（Didymellaceae）真菌是一类广泛分布于世界各地的重要真菌，以植物病原菌、内生菌、腐生菌等多种形式存在于各种地理生态环境中。该科大多数物种具有植物病理学重要性，是各国家地区的植物进境检疫物种，此外还有作为生物防治剂的潜力。由... 展开亚隔孢壳科（Didymellaceae）真菌是一类广泛分布于世界各地的重要真菌，以植物病原菌、内生菌、腐生菌等多种形式存在于各种地理生态环境中。该科大多数物种具有植物病理学重要性，是各国家地区的植物进境检疫物种，此外还有作为生物防治剂的潜力。由于目前，该科中有许多未知的物种，因此，为揭示该科中大量的物种，掌握我国西南地区亚隔孢壳科真菌种类，以及对该科生物多样性的认识。本研究采集大量植物的发病叶片，分离纯化其致病病原菌，利用分子系统学和形态特征差异对病原菌的分类地位进行鉴定。本研究从2018年~2020年在我国西南（贵州省，云南省，四川省，广西省等地）的部分地区采集的植物病害标本中分离到57株亚隔孢壳科真菌。通过4个基因（ITS,LSU,rpb2,tub2）的多基因系统发育分析与形态学分析相结合的方法对这些菌株进行鉴定，结果表明：57株亚隔孢壳科真菌隶属于8个属中，分别为，Allophoma(8株)，Ectophoma（8株），Heterophoma（3株），Stagonosporopsis（3株），Boeremia（1株），Nothophoma（7株），Epicoccum（11株），Didymella（16株），共鉴定出11个种，其中3个新种，分别命名为Allophoma thunbergiae,Stagonosporopsis actinidiae,Heterophoma capsicus；8个已知种，分别为Allophoma pterospermicola,Allophoma tropica,Ectophoma iranica,Ectophoma multirostrata,Nothophoma brennandiae,Epicoccum latusicollum,Epicoccum cedri,Didymella sinensis；明确2个中国新纪录种；需进一步鉴定的3个疑似新种；未定种26个。采用柯赫氏法则对部分菌株进行致病性测定，接种植物后发病，重新分离到相同的病原物，说明分离到的菌株是该植物的病原菌，本研究共分离验证了4个植物病原菌。本研究是应用分子系统学研究方法，首次对中国西南地区亚隔孢壳科真菌进行系统的鉴定分类和修订，结果明确了中国西南地区亚隔孢壳科真菌部分属的系统发育关系及寄主的广泛性，为这一类真菌引起的病害防治提供重要的理论指导。收起

关键词 : 亚隔孢壳科真菌分子系统学形态特征生物多样性病害防治

3. 成都地区竹生梨孢假壳科真菌的分类及分子系统学研究

[学位论文] 宋京易电子科技大学 2023年硕士导师: 刘建魁共115页

摘要 : 中国西南地区作为全球的生物多样性研究热点地区之一，孕育了丰富的生物资源。成都地处我国西南地区，有着特殊的地理和气候特点，也孕育了丰富的植被资源，其中竹子作为极具代表的物种在成都地区具有广泛的分布。丰富的竹子资源同时蕴含了较为多样的... 展开中国西南地区作为全球的生物多样性研究热点地区之一，孕育了丰富的生物资源。成都地处我国西南地区，有着特殊的地理和气候特点，也孕育了丰富的植被资源，其中竹子作为极具代表的物种在成都地区具有广泛的分布。丰富的竹子资源同时蕴含了较为多样的竹生真菌物种，然而成都地区的竹生真菌研究却相对缺乏。因此，本研究通过对成都全区域进行大规模竹生真菌标本采集，利用传统形态学特征并结合基于多基因片段构建系统发育树等方法，对成都地区的竹生真菌开展分类学及分子系统学的研究。主要研究结果如下：1）在成都地区共采集300份竹子标本，分离纯化出349株真菌纯培养物，经过初步鉴定，Amphisphaeriales为粪壳菌纲的优势目；科水平分析表明，梨孢假壳科为第一大优势科，Apiospora为优势属，其中Apiosporaparaphaeosperma占所采集该科菌株的29%（9/31），作为Apiospora的优势种进行描述；2）对梨孢假壳科内分类单元的部分物种分类地位进行了修订，Apiosporahispanica作为Ap.mediterranea的同物异名，Ap.vietnamensis为Ap.chromolaenae的同物异名和Arthriniumphaeospermum更名为Apiosporaphaeospera；3）通过系统的分析将梨孢假壳科内31个菌株鉴定为20个不同物种，其中包含10个疑似新种和10个已知种（包含4个新纪录种）。其中已知种包括：Apiosporaneosubglobosa（R6-2）、Ap.septate（X4-1）、Ap.thailandica（SD16-1）、Ap.arundinis（HK32-1）、Ap.paraphaeosperma（WJ14-1）、Ap.rasikravindrae（HK2-3）；提供了4个物种的有性型新纪录：Ap.lageniformis（D22-1）、Ap.hydei（HK37-1）、Ap.pseudoparenchymatica（WJ2-1）、Ap.hysterina（D5-1）；4）研究过程中也发现一些疑似新种，并对这些种进行了鉴定和描述；Dictyosporellasp.nov.（CX6-4）、Fasciatisporasp.nov.（CX13-1）、Bifusisporellasp.nov.（HK36-1）、Magnaporthaceaesp.nov.（CZ1-3）、Neogaeumannomycessp.nov.（WJ7-1）、Conlariumsp.nov.（HK39-2）、Nigropunctatasp.nov.（B3-1）。收起

关键词 : 竹生梨孢假壳科真菌梨孢假壳科分类学系统发育学

4. 重要致病性暗丝孢科真菌分子生物学研究

[学位论文] 张宏北京协和医学院(中国医学科学院) 1996年博士导师: 吴绍熙共85页

关键词 : 暗丝孢科真菌分子生物学

5. 四种石杉科植物中产生石杉碱甲的内生真菌的分离、鉴定和其石杉碱甲含量的测定

[学位论文] 鞠錾复旦大学 2009年硕士导师: 潘胜利共60页

摘要 : 痴呆是由于脑功能障碍而产生的获得性智能损害综合症。通常引起痴呆的原因包括变性病性和非变性病性,前者主要包括阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)和额颞痴呆等;后者主要包括血管性痴呆、感染性痴呆、代谢性和中毒性脑病。其中以阿尔茨海默型痴... 展开痴呆是由于脑功能障碍而产生的获得性智能损害综合症。通常引起痴呆的原因包括变性病性和非变性病性,前者主要包括阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)和额颞痴呆等;后者主要包括血管性痴呆、感染性痴呆、代谢性和中毒性脑病。其中以阿尔茨海默型痴呆和血管性痴呆。老年痴呆,心、脑血管疾病和恶性肿瘤已成为老年人致残、致死的四大疾病。而老年痴呆症已成为常见的死亡原因的第四位。20世纪80年代初,我国科学家首先从中国民间草药“千层塔”中分离到石杉碱甲(Huperzine A),经药理实验证明它是一种低毒、高效、可逆和高选择性的乙酰胆碱酯酶抑制剂,有强效、高选择性的抗乙酰胆碱酯酶活性及提高学习和改善老年人记忆功能的作用。目前已有新药上市,广泛用于阿尔茨海默病和血管性痴呆的治疗。到目前为止,石杉碱甲仅发现存在于石杉科植物中。石杉科植物是现存的最古老的蕨类植物类群之一,曾繁盛于古生代,后随种子植物的崛起而大多灭绝。现残存的种类,绝大部分为腐生或寄生,多分布于人迹罕至的原始森林中,且生长缓慢、植株矮小,对空气、光照、温度、湿度等因素要求苛刻。近年来,随着石杉碱甲被分离并广泛应用于临床,掀起了研究开发的热潮,对其需求也越来越大,人们便开始对石杉科植物的掠夺式开发,再加上其它因素如生态环境恶化等的威胁,使其资源越来越匮乏。目前尽管报道了多种石杉碱甲的全合成方法,但是价格昂贵,步骤繁琐,基本没有实用价值。石杉科植物中存在多种内生真菌,内生真菌种类繁多,在寄主植物组织内部的生长发育过程中,其代谢产物对植物体本身有着各种各样的影响。本文选取了四种石杉科植物并对其的内生真菌进行研究,得到产生石杉碱甲的内生真菌,根据显微形态对菌种进行了初步鉴定,改进筛选内生真菌的培养条件,并建立了HPLC方法来检测内生真菌代谢产物中的石杉碱甲的含量。另外,本文还使用组织培养方法来培养石杉科植物。 1.四种石杉科植物的内生真菌的培养和分离选用四种含有石杉碱甲的石杉科植物:蛇足石杉,长柄石杉,伏贴石杉,柳杉叶马尾杉,对其进行灭菌等处理经培养得到内生真菌,采用平板划线法进行菌种分离纯化,并对真菌进行观察,拍照记录。反复实验中得到适合筛选内生真菌的培养基为MS培养基和培养温度为28℃。 2.样品处理和石杉碱甲含量测定方法利用得到的内生真菌的样品和石杉碱甲标准品,经反复实验确定了HPLC的测定方法,发现了2株内生真菌能够产生石杉碱甲,并测定了真菌样品中石杉碱甲含量。 3.内生真菌菌种鉴定观察并记录内生菌落培养特征和显微形态特征,对照有关资料确定真菌的分类学地位。这两个菌株分别为芽胞菌属(Blastomyces Cost.ex Roll.),葡萄孢属(BotrytisPers.ex Fr.)。 4.石杉碱甲检测条件优化比较了提取液经碱化再用有机溶剂萃取除杂质和直接测定提取液的效果。考察了超声提取时间和不同提取溶剂对提取效果的影响;还考察了不同紫外检测波长对检测的影响,得出最优化检测条件为:采用酒石酸超声1h提取,经碱化后用氯仿萃取,测定的波长为310nm。并发现该优化的条件适合更多石杉类内生真菌样品的测定。 5.石杉科植物的组织培养选取七种石杉科植物的茎叶和孢子,采用组织培养的方法对其灭菌和培养。结果发现茎叶的组织培养均未发现愈伤组织生成,孢子培养也非常缓慢,仅有华南马尾杉的孢子在8个月后萌发。收起

关键词 : 石杉科植物石杉碱甲内生真菌菌种鉴定

6. 来自甘肃和青海的核盘菌中病毒种类鉴定及SsVV2的分子特性研究

[学位论文] 周志华中农业大学 2022年硕士导师: 付艳苹共86页

摘要 : 核盘菌（Sclerotiniasclerotiorum）是油菜、大豆等作物菌核病的病原物，是一种危害性很大的植物病原真菌。真菌病毒是指能够在真菌中复制和增殖的一类病毒，且低毒相关真菌病毒是一种潜在的生防因子。核盘菌中蕴含着丰富的真菌病毒资源。本研究以分离... 展开核盘菌（Sclerotiniasclerotiorum）是油菜、大豆等作物菌核病的病原物，是一种危害性很大的植物病原真菌。真菌病毒是指能够在真菌中复制和增殖的一类病毒，且低毒相关真菌病毒是一种潜在的生防因子。核盘菌中蕴含着丰富的真菌病毒资源。本研究以分离自甘肃和青海两省的核盘菌为研究材料，分析了两地核盘菌群体中的病毒种类，克隆获得了一个全病毒科病毒SsVV2的基因组全长，分析了SsVV2的分子特性，并测定了携带SsVV2的低毒菌株DT-110的生物学特性。此外还评估了低毒菌株ML-10的生防潜力。具体的研究结果如下：分析了我国春油菜区核盘菌中的真菌病毒种类，评估了低毒菌株ML-10的生防潜力。自甘肃省民乐县和青海省大通县两地发病油菜植株上采集核盘菌菌核，共分离纯化获得116个核盘菌菌株。基于宏病毒组分析，鉴定到分离菌株中含有50种真菌RNA病毒，包括15种新病毒。其中+ssRNA基因组病毒占比70%，dsRNA基因组病毒占比18%，-ssRNA基因组病毒占比12%，未检测到DNA病毒。鉴定的病毒主要隶属于葡萄孢欧尔密病毒科、线粒体病毒科、减病毒科、内源病毒科和全病毒科等15个病毒科以及一些分类地位尚未明确的病毒，表明分离自春油菜种植区的核盘菌群体中病毒种类丰富。对低毒菌株ML-10的生防潜力进行评估，发现经菌株ML-10的菌丝液处理活体油菜植株，可有效防控菌核病发生。鉴定了低毒菌株DT-110中的病毒种类，并且克隆了Sclerotiniasclerotiorumvictorivirus2（SsVV2）的全长cDNA序列。以强毒力菌株1980为对照，发现菌株DT-110的菌落形态不规则、菌丝生长速度慢、菌核数量减少且变小，并且致病力减弱。通过宏病毒组深度测序，明确了菌株DT-110中除了SsVV2外，还携带隶属于葡萄孢欧尔密病毒科的病毒Sclerotiniasclerotiorumourmia-likevirus7、丁型线性病毒科的病毒Sclerotiniasclerotiorumdeltaflexivirus3、布尼亚病毒科的病毒Sclerotiniasclerotiorumbunyavirus6-A等4个病毒以及4个分类地位还未确定的病毒SclerotiniasclerotiorumdsRNAmycovirus-A、SsNSRV2、SsNSRV5和SsNSRV10。结合RACE技术，获得SsVV2的全长cDNA序列，SsVV2基因组全长含有5123个核苷酸（nt），编码两个重叠的开放阅读框（ORF），ORF1编码含有755个氨基酸（aa）的外壳蛋白（CP），ORF2编码834aa的依赖RNA的RNA聚合酶（RdRp）。多重比对分析表明SsVV2的RdRp含有8个保守基序，同源性分析表明SsVV2与已报道的病毒Sclerotinianivalisvictorivirus1（SnVV1）有74.7%的相似性，基于RdRp和CP分别构建系统发育树，结果支持SsVV2与SnVV1聚为一支，为全病毒科（Totiviridae）中维多利亚病毒属（Victorvirus）的成员。本研究探究了来自甘肃省和青海省的核盘菌中的真菌病毒种类，克隆了隶属于全病毒科的新病毒SsVV2的基因组全长，评估了低毒核盘菌DT-110的生物学特性及低毒核盘菌ML-10的生防潜力。研究结果为核盘菌病毒资源库增添了更多的真菌病毒信息，也为菌核病的防控提供新的生防材料。收起

关键词 : 核盘菌真菌病毒弱毒特性全病毒科

7. 膨瑚菌科的系统发育框架及中国广义小奥德蘑属的物种

[学位论文] 郝艳佳中国科学院大学 2016年博士导师: 杨祝良共190页

摘要 : 膨瑚菌科(Physalacriaceae)真菌形态各异、营养方式复杂、生态类型多样、分布广泛，且具有重要的经济价值和生态意义。前人对该科主要开展了基于形态解剖特征的分类研究，并在科下部分属内开展过分子系统发育分析，但尚未对整个科开展过多基因系统发育... 展开膨瑚菌科(Physalacriaceae)真菌形态各异、营养方式复杂、生态类型多样、分布广泛，且具有重要的经济价值和生态意义。前人对该科主要开展了基于形态解剖特征的分类研究，并在科下部分属内开展过分子系统发育分析，但尚未对整个科开展过多基因系统发育研究，且对该科下广义小奥德蘑属（Oudemansiella s.1.）的系统处理一直存在争议，有人将它作为一个属，有人将它拆分为多属，属内物种划分标准亟待建立。在研究约600号标本和测得700余条序列后，采用多个基因片段序列，作者重建了膨瑚菌科的系统发育，并着重关注了小奥德蘑属的系统修订和中国该属的物种多样性。本研究主要内容包括：⑴采用ITS、nrLSU、翻译延伸因子编码基因和RNA聚合酶Ⅱ第二大亚基编码基因（rpb2）四个基因片段，选取膨瑚菌科19个属84个代表物种，对该科进行了系统发育重建。发现蜜环菌属和圭腹菌属为该科基部类群;柱担菌属、膨瑚菌属和三尾菌属亲缘关系密切;缘网粉菇属和冬菇属是姐妹类群;沼伞属等10余个属聚为一个大支，其中球果伞属和干蘑属、假裂缝伞属和金褴伞属、无褶伞属和根皮伞属分别为姐妹群。该科重要的形态分类特征如假根有无、盖表鳞片有无、菌环有无、腹菌化和寄生性营养方式都经历了两次或多次独立演化。此外建立了新属刺孢伞属，有助于认识膨瑚菌科孢子纹饰的演化。⑵选取广义小奥德蘑属42个物种为代表，基于ITS、nrLSU、tef1-a、rpb2和β-微管蛋白编码基因五个基因片段，对该属进行了系统发育重建。结果显示广义的小奥德蘑属是一个单系类群，应将其处理为一个独立的属，并提出了一个包含3个组的新分类系统，即小奥德蘑组O.sect.Oudemansiella、刺孢组O.sect.Dactylosporina和长根组O.sect.Radicatae。小奥德蘑组的物种分布于热带至温带地区，且均为树生习性，菌盖表面具鳞片、菌盖表皮为含菌丝的粘栅栏型，孢子无指状疣凸。刺孢组则包含了分布于中南美洲且孢子有指状凸起、菌盖表面无鳞片、盖表皮为粘拟子实层型的物种。长根组以长根小奥德蘑O.radicata及其近缘种为代表，是该属中最大的组，包括了该属其他两组之外的所有种，这些物种菌盖表面无鳞片、盖表为粘拟子实层-栅栏型、孢子无指状疣凸。该组真菌广泛分布于欧亚、非洲、北美和澳大拉西亚地区。⑶选取小奥德蘑属185号样品，以ITS、nrLSU、tef1-α、rpb2和β-tubulin作为分子标记，分别基于五个单基因矩阵和联合矩阵构建该属的系统发育树，采用多基因谱系一致性系统发育种识别方法(GCPSR)识别系统发育种。结合系统发育和形态学研究，发现我国该属共有物种22个，其中包含9个新种，即:哀牢山小奥德蘑O.ailaoshanensis、椭孢小奥德蘑O.ellipsospora、光滑小奥德蘑O.glabra、鸡足山小奥德蘑O.jizushanensis、瓶囊小奥德蘑O.lageniformis、小孢小奥德蘑O.microspora、桃孢小奥德蘑O.persiciospora、拟卵孢小奥德蘑O.subraphanipes和昭通小奥德蘑O.zhaotongensis。并报导了我国3个新记录种:丝盖小奥德蘑O.magisterium、褐囊小奥德蘑O.aureocystidiata和水田氏小奥德蘑O.mizutai。编制了我国小奥德蘑属22个物种的分种检索表，并对它们进行了详细地描述和绘图。研究表明盖表囊状体的有无、菌盖表皮结构、盖表鳞片结构、褶侧囊状体和褶缘囊状体的形状和颜色、柄生囊状体的有无、孢子形状、大小和表面纹饰等可作为小奥德蘑属下物种的鉴别特征。收起

关键词 : 真菌发育膨瑚菌科物种多样性基因表达

8. 中国西南地区附毛孢科(Sporocadaceae)病原真菌系统学研究

[学位论文] 杨琪贵州大学 2022年硕士导师: 王勇共131页

摘要 : 附毛孢科（Sporocadaceae）真菌常作为植物上的病原菌、内生菌及腐生菌，广泛分布于热带和亚热带地区，可引起叶斑病、茎枯病和果腐病等多种病害，危害作物健康。2019年重新修订的分类系统将拟盘类真菌（Pestalotiopsis-like）归入附毛孢科，并成为其... 展开附毛孢科（Sporocadaceae）真菌常作为植物上的病原菌、内生菌及腐生菌，广泛分布于热带和亚热带地区，可引起叶斑病、茎枯病和果腐病等多种病害，危害作物健康。2019年重新修订的分类系统将拟盘类真菌（Pestalotiopsis-like）归入附毛孢科，并成为其主要类群。尽管如此，该科部分少见属、种仍存在界限不清等问题。本研究主要从中国西南部分地区采集寄主病害标本，对所获得的附毛孢科病原菌开展分子系统学和形态学研究，为完善该科真菌分类学研究提供数据支撑，同时为相关病害防治提供理论指导，有着较重大的学术价值及应用潜力。本研究于2019年至2021年在中国西南部分地区（贵州省，云南省，四川省，广西省等地）的各大植物园采集典型植物病害叶片标本，共500份，涉及40科59属65种植物。经分离纯化共获得附毛孢科菌株137个，ITS-Blast显示这些菌株分布在6个属，其中Pestalotiopsis91株，Neopestalotiopsis37株，Pseudopestalotiopsis4株，Robillarda3株，Discosia1株，Hymenopleella1株。通过多基因（ITS,RPB2,TUB2和TEF1）系统发育学与形态学研究相结合的方法对菌株的分类地位进行分析，所获菌株包括28个种，其中新种9个（Hymenopleella rhododendronis,Pestalotiopsis curculiginis,P.linderae,P.musae,P.populi-tomentosae,P.championiae,P.camelliae-japonicae,P.japonicae,P.fici）；已知种19个（3个中国新纪录种），分别为Neopestalotiopsis cubana,N.ellipsospora,N.rhapidis,N.rhododendri,N.rosicola,N.saprophytica,Pestalotiopsis chamaeropis,P.grandis-urophylla,P.kaki,P.kenyana,P.neolitseae,P.papuana,P.rhodomyrtus,P.sichuanensis,Pseudopestalotiopsis celtidis,Ps.ignota,Ps.indocalam,Ps.theae,Robillarda africana。此外，还有未定种17个。采用柯赫氏法则对10个疑似植物病原菌进行致病性测定，结果表明接种植物发病症状与田间症状类似，且重新分离纯化后所获得的菌株经鉴定与所接种菌株为同一个种，因此所分离获得的菌株是导致植物病害的病原菌。本研究进一步阐明附毛孢科部分属种真菌在我国西南部分地区分布广泛，多样性较为丰富，新分类单元和进化分枝的介绍为系统学研究提供了更广泛的数据支撑，对附毛孢科真菌病害的防治和资源利用具有重要意义。收起

关键词 : 植物病原菌附毛孢科真菌分类学病害防治

9. 中国楔形衣科地衣型真菌的分类研究

[学位论文] 朱孟丽聊城大学 2022年硕士导师: 贾泽峰共119页

摘要 : 楔形衣科（Gomphillaceae）地衣型真菌隶属于真菌界（Fungi）、子囊菌门（Ascomycota）、茶渍纲（Lecanoromycetes）、厚顶盘目（Ostropales），其模式属为GomphillusNyl.。目前为止，全世界共报道该科有26属560余种；中国报道11个属37种。楔形衣科广... 展开楔形衣科（Gomphillaceae）地衣型真菌隶属于真菌界（Fungi）、子囊菌门（Ascomycota）、茶渍纲（Lecanoromycetes）、厚顶盘目（Ostropales），其模式属为GomphillusNyl.。目前为止，全世界共报道该科有26属560余种；中国报道11个属37种。楔形衣科广泛分布于热带、亚热带。该科主要识别特征为：地衣体多为叶生，壳状；表面呈绿色、橄榄绿、灰绿色等；光滑至具疣体，多分布刚毛，白色、棕色至黑色；子囊盘多为蜡盘型或双缘型；侧丝清晰，具有丰富的分支；子囊含1~8孢，非淀粉质；子囊孢子横隔型或砖壁型，卵圆形至椭圆形；分生孢子器主要为分生孢子柱，刚毛状，顶端圆钝或锐尖；分生孢子穗着生于顶端或近顶端，分支丰富；大多无化学物质；共生光合物为绿球菌（Chlorococcoid）。国外学者对楔形衣科的研究比较系统和全面，而国内学者对该科的研究较少，目前仅见零星种的报道，因此亟需进一步全面系统的研究。本研究基于形态学、解剖学、地理学以及分子生物学等方法综合研究，对馆藏于聊城大学生命科学学院地衣标本室（LCUF）、中国科学院微生物研究所菌物标本馆地衣标本室（HMAS-L）和山东师范大学植物标本室（SDNU）的标本共计500余份进行了研究。研究过程中，还对部分地区进行了标本补采，主要是热带和亚热带地区。本研究新增楔形衣科新种8种：Caleniacrassimarginata、C.occultans、C.pseudodepressa、C.subphyllogena、C.viridis、Echinoplacainfuscata、Trichariahorizontaris和T.minocarpa；中国新记录种13种：Aderkomycesalbostrigosus、A.couepiae、A.papilliferus、Asterothyriumanomalum、Caleniaphyllogena、C.pseudographidea、Echinoplacaepiphylloides、E.intercedens、E.marginata、E.melanotrix、Gyalideopsismontana、G.pallescens和Trichariademoulinii。本论文对每个种进行了详细的描述和讨论，并给出了属种检索表，提供了每个种的形态和解剖照片。本论文首次系统地研究了中国楔形衣科地衣，为进一步研究地衣生物多样性积累了资料，也为地衣的保护和资源利用提供了依据，同时为中国地衣志的编写与研究提供了基础资料和数据。收起

关键词 : 楔形衣科地衣型真菌分类体系生物多样性

10. 产酶溶杆菌TCSTSs和T4P系统的基因鉴定及T4P基因簇部分基因的功能初析

[学位论文] 周雪南京农业大学 2015年博士导师: 刘凤权共131页

摘要 : L.enzymogenes属于黄单胞科，溶杆菌属。其全基因组中的GC含量较高，并且菌体具有滑行能力。从文献资料可知，OH11菌株和C3菌株能产生多种胞外酶和有抑菌效果的刺激代谢产物，使其对多种植物病原菌均拥有较强的抑制能力，具有十分广阔的应用前景。本文... 展开 L.enzymogenes属于黄单胞科，溶杆菌属。其全基因组中的GC含量较高，并且菌体具有滑行能力。从文献资料可知，OH11菌株和C3菌株能产生多种胞外酶和有抑菌效果的刺激代谢产物，使其对多种植物病原菌均拥有较强的抑制能力，具有十分广阔的应用前景。本文的宗旨是初步探寻参与调控L.enzymogenes生防能力及蹭动运动能力的基因网络，并对其中的部分基因进行深入研究。双组份信号传导系统TCSTSs（Two-Component Signal Transduction Systems）是研究了多年的一种普遍而又重要的信号传导体系，在很多菌株中对其都有不同程度的研究。典型的TCSTSs由感应组氨酸激酶蛋白(HK)和调控蛋白(RR)组成。在L.enzymogenes OH11中，通过生物信息学方法从全基因组中初步预测出54个HK基因和54个RR基因，并经过蛋白结构域以及序列保守位点的鉴定确认其准确性。并且，根据文献资料的报道对54个HK蛋白和54个RR蛋白进行了分类处理，将HK蛋白分为6类;将RR蛋白分为3大类，12小类。同时，总结所有的基因，找到40组典型的基因对，并从中发现了数对在黄单胞菌株中报道过的致病相关基因同系物。本次研究首次从L.enzymogenes中找出全部可知的双组份信号传导系统，为之后的研究奠定了基础。热稳定抗真菌因子HSAF(HSAF)是近些年研究较为热门的一种重要的次级代谢产物，可以抑制真菌、卵菌、线虫等病原生物。在L.enzymogenes C3中，验证TCSTSs是否影响HSAF的表达是本次试验的最初目的。通过实验，初步筛选出了10个降低或缺失HSAF产量的RR突变体，和2个升高HSAF产量的RR突变体，并且发现这些突变体分属于数个不同的基因家族。因此认为TCSTSs参与调控多种细菌的生物学功能，并且这些含有TCSTSs的基因簇在一定程度上可以影响HSAF的产量。同时，通过序列分析，发现提高HSAF产量的其中一个基因属于四型菌毛系统(TypeⅣ Pili，T4P)，表明T4P和TCSTSs之间相互存在着一定的联系。 TypeⅣ pili(T4P)是最常见的一种菌毛（纤毛）类型。它们一般位于细胞极性一端或者两端，能够产生蹭动运动。在多数的病原菌中，T4P同样影响菌株致病性的表达。L.enzymogenes虽然没有鞭毛，但是仍然具有运动能力，因此认为L.enzymogenes的运动能力与T4P有重要关系。同时，参考病原物的致病性，认为Lenzymogenes的生防能力也与T4P有着紧密关联。此家族中基因数量众多，通过生物信息学，从L.enzymogenes OH11全基因组中发现41个TypeⅣ系统相关的基因同系物。其中有2对典型的双组份基因，5个孤立的RR/HK蛋白，表明T4P与TCSTSs有着紧密的联系。同时还发现，L.enzymogenes OH11中的T4P比P.aeruginosa缺少了pilK、fimU和fimZ，多了一组完整的pilE/X/Y/V基因。并且，整个T4P家族中有较为完整的Pil-Chp基因簇，其中包含能够提高HSAF产量的基因pilG。这个结果为后续的研究提供了较为清晰的方向。 Pil-Chp是一类在TypeⅣ的研究中发现的菌毛趋性基因簇。根据基因预测的实验结果，从中选取了既是双组份基因又是T4P基因的pilG、chpA和T4P中的供能基因pilB进行初步分析。依据试验分析，认为ChpA可以和PilG结合，是一组非典型的双组份系统，同时还存在其他的HK基因可以与PilG结合。⊿chpA、⊿pilG和⊿pilB突变体都能提高EPS的表达量，同时改变L.enzymogenes C3的蹭动运动和菌落形态，说明pilG、chpA和pilB在L.enzymogenes C3的蹭动运动中起着重要的作用。但⊿pilG和⊿pilB都能够提高HSAF和WAP的产量，而⊿chpA却没有太大的影响，说明在产酶溶杆菌C3中chpA基因可能部分影响pilG基因的功能。同时，实验结果表明在产酶溶杆菌C3中可能出现了一种新的调控方式。收起

关键词 : 产酶溶杆菌基因鉴定抗真菌因子生防能力黄单胞科