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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 通过转录组的研究有助于揭示人特异性表型调控的分子机制,包括RNA高通量测序技术在内的出现及高速发展,为此提供了极好的机会。在我硕士期间,我和同事找出了miR-941的重要调控介质mi R-941海绵TP73-AS1,通过进化研究解析了它在序列以及表达水平的... 展开 通过转录组的研究有助于揭示人特异性表型调控的分子机制,包括RNA高通量测序技术在内的出现及高速发展,为此提供了极好的机会。在我硕士期间,我和同事找出了miR-941的重要调控介质mi R-941海绵TP73-AS1,通过进化研究解析了它在序列以及表达水平的演化过程;然后通过体内体外实验验证了二者之间的相互调控关系,最终揭示了TP73-AS1与miR-941在癌症发生发展过程中的调控功能。 基于新测序的4个人脑前额皮质组织的高通量测序数据和公共数据库中的54个人脑样本数据,构建出的非编码RNA转录本数据库,并找出了miR-941海绵TP73-AS1,对其序列分析阐释了它与miR-941高亲和性的原因;然后对TP73-AS1的进化研究发现它在序列和表达水平呈现出加速进化模式,此外,TP73-AS1在灵长类动物中差异表达,在人与类人猿中表达量比在与人亲缘关系远的旧世界猴子(OWM)与新世界猴子(NWM)中表达量高,与其调控产物miR-941的快速进化相吻合。 接下来,通过293T细胞转染实验和AGO2-IP实验结合时序RNA测序数据和小RNA测序数据分析,证实了TP73-AS1与miR-941在体内的直接相互作用。细胞迁移实验发现TP73-AS1能拮抗miR-941引起的细胞迁移抑制,大规模表达谱系分析表明它是一种潜在的肿瘤抑制因子,其抑癌作用在黑色素细胞向黑色素瘤细胞转化过程的研究中得到证实。 以上两部分研究从进化和功能两方面对TP73-AS1进行了研究,扩充了我们对转录组调控和生物系统复杂度的理解。 收起
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