摘要: 海南坡鹿是国家Ⅰ级重点保护野生动物，属反刍动物，肠道微生物对其生存有重要意义，肠道中存在的微生物群落是该物种长期进化的结果，与动物的食性、机体免疫、营养需求等关系密切。通过拮抗实验筛选出益生芽孢杆菌，并采用高通量测序的技术，对海南... 展开 海南坡鹿是国家Ⅰ级重点保护野生动物，属反刍动物，肠道微生物对其生存有重要意义，肠道中存在的微生物群落是该物种长期进化的结果，与动物的食性、机体免疫、营养需求等关系密切。通过拮抗实验筛选出益生芽孢杆菌，并采用高通量测序的技术，对海南坡鹿的肠道菌群做16S rRNA测序分析，挖掘肠道菌群中的优势菌群，研究结果如下: 1、从健康海南坡鹿粪便中分离有益生潜力的芽孢杆菌，综合形态学、生理生化分析及分子学鉴定对筛选菌株进行鉴定，最终确定益生芽孢杆菌2-1-1为芽孢杆菌属、Y17为短小芽孢杆菌。 2、通过构建菌群16S rRNA基因克隆文库和进行系统发育分析，对采集自广州动物园健康成年海南坡鹿的16个粪便样品的菌群结构和多样性进行分析，结果表明海南坡鹿粪便菌群分属于18个菌门，其中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是核心菌门，分别占比50.49％和36.52％。 海南坡鹿肠道菌群中丰度最高的前10个属分别为5-7N15，丰度值为7.181％、普雷沃菌属（Prevotella，3.159％）、密螺旋体属（Treponema，2.788％）、琥珀酸弧菌属(Succinivibrio，2.545％)、颤螺菌属(Oscillospira，2.304％)、CF231丰度值1.843％、瘤胃球菌属(Ruminococcus，1.652％)、艾克曼菌属(Akkermansia，1.439％)、短杆菌属(Methanobrevibacter,1.340％)、梭菌属(Clostridium,1.333％)。 3、对比不同性别海南坡鹿肠道菌群，通过T-test检验，统计出具有差异显著(p_value＜0.05)的属共17个，在A组中丰度较高的属有:脱硫弧菌属（Desulfovibrio）、Ruminobacter、梭菌属（Clostridium）、p-75-a5、草酸杆菌属（Oxalobacter）、02d06、埃希氏菌属（Escherichia）、YRC22、BF311、SHD-231、毛螺菌属（Lachnospira）;在B组中丰度较高的属有:5-7N15、Butyricicoccus、Phascolarctobacterium、Anaeroplasma、Dorea、Blautia。 收起