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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 本研究以259只郓城小尾寒羊为研究对象,利用DNA混合池测序方法和直接测序技术检测小尾寒羊脂联素基因(ADPN)的内含子2和外显子3、3'UTR区多态性及类胰岛素生长因子1(IGFl)基因5'UTR和外显子2和内含子2多态性;用Codoncode Aligner4.0对测序结果判别纯... 展开 本研究以259只郓城小尾寒羊为研究对象,利用DNA混合池测序方法和直接测序技术检测小尾寒羊脂联素基因(ADPN)的内含子2和外显子3、3'UTR区多态性及类胰岛素生长因子1(IGFl)基因5'UTR和外显子2和内含子2多态性;用Codoncode Aligner4.0对测序结果判别纯合子和杂合子情况;使用SHEsis软件分析基因的连锁不平衡状态;用Popgen3.2软件统计基因突变位点的遗传多态性;用Molkin3.0计算基因型频率和群体多态信息含量(PIC)值等值;用SAS9.0软件分析基因多态性与繁殖性状、体尺体型指数、血液理化性状间的关联效应。结果表明: (1)所研究群体中,在ADPN基因内含子2和外显子3部分序列中共检测到6个SNPs,即10436位的G/A、10454位的A/G、10660位的T/C、10677位的C/T、10732位的C/T和10753位的C/T,均处于H-W平衡状态(P>0.05),经过连锁不平衡分析发现10436位与10660位处于完全连锁状态,10677位与10753位处于完全连锁状态;在IGF1基因外显子2及内含子2检测到2个SNPs,即4908C/T、4988G/A,其等位基因和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。 (2)在与产羔数关联分析中,ADPN基因的10454位点突变对第四胎产羔数影响达到显著(P<0.05)水平;IGF1基因中,4908位点的CT基因型个体第三胎产羔数极显著(P<0.01)多于CC基因型个体,存在极显著的等位基因替代效应(P<0.01);4988位点上等位基因A为校正产羔数的有利等位基因。 (3)在与体尺、体型指数关联分析中,ADPN基因各位点上年龄效应对性状影响除管围外均达到显著(P<0.05)或者极显著(P<0.01)水平,基因型和互作效应对性状影响均不显著;IGF1基因两个位点上年龄对性状的影响除管围外均达到显著(P<0.05)或者极显著(P<0.01)水平,基因型效应不显著,4988位点互作效应对十字部高、体高和体长指数影响达到极显著水平(P<0.01); IGF1基因4988位点突变对2岁羊群体十字部高和体高影响达到显著(P<0.05)水平。等位基因A对l岁羊群体的体长指数具有负效应。 (4)在与血液理化指标关联分析中,ADPN基因六个突变位点对不同年龄段小尾寒羊碱性磷酸酶产生显著(P<0.05)或者极显著(P<0.01)影响;10732位点突变对甘油三酯5岁羊和全群影响也达到极显著(P<0.01)水平。IGF1基因4908位点突变对碱性磷酸酶和总胆固醇以及血红蛋白含量产生显著(P<0.05)或者极显著(P<0.01)的影响。 (5) ADPN基因的单倍型效应及其交互作用对部分体尺体型指数、血液理化性状产生显著或者极显著影响;IGF1基因的单倍型效应及其交互作用对血液理化性状产生影响。 (6) ADPN与IGF1基因间交互作用对产羔数、部分体尺性状和生理生化部分性状产生影响。 本研发现ADPN基因与产羔数和血液理化性质相关,IGF1基因与小尾寒羊产羔数和体尺、血液理化性质有显著关联效应,可以作为小尾寒羊生产性状的分子标记;ADPN和IGF1基因间存在交互作用,构建的优势复合基因型有利于加速育种工作进程。 收起
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