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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 目的:通过检测心脏发育中的重要转录因子GATA4基因在房室隔缺损(AVSD)患者中的突变情况以及应用生物信息学方法预测突变点对蛋白功能的影响,探讨其在先天性房室隔缺损发病机制中的作用。 方法:收集61例汉族AVSD患者和100例汉族正常人对照组的... 展开 目的:通过检测心脏发育中的重要转录因子GATA4基因在房室隔缺损(AVSD)患者中的突变情况以及应用生物信息学方法预测突变点对蛋白功能的影响,探讨其在先天性房室隔缺损发病机制中的作用。 方法:收集61例汉族AVSD患者和100例汉族正常人对照组的血液标本,应用PCR方法扩增GATA4基因6个编码外显子的序列和两侧各50个碱基以上序列,并对扩增产物进行测序。将患者扩增的GATA4基因编码序列与GenBank人GATA4基因编码序列进行比对,并与正常人对照组比较,观察GATA4突变情况。采用统计学方法比较在AVSD合并21-三体综合征与非合并21-三体综合征的患者中检出GATA4的突变率有无差异。利用生物信息学的方法(SIFT)预测基因突变可能对GATA4蛋白功能的影响。 结果: 1.在61例患者(包括合并21-三体综合征7例,非综合征病例54例)中检出2例错义突变(碱基变化为C106G、A1129G,氨基酸改变分别为P36A、S377G),两例均为非21-三体综合征AVSD患者。 2.GATA4基因编码第36 位脯氨酸和第377位丝氨酸在生物进化过程中均处于高度保守。 3.GATA4突变率在AVSD合并21-三体综合征(0/7)与非合并21-三体综合征(2/54)的患者中的比较,采用Fisher’s确切概率法,P=0.782(P>0.05),两组突变率的差异无统计学意义。 4.利用SIFT程序预测GATA4基因P36A点突变概率P值是0.00(P<0.05),S377G点突变概率P值是0.63(P>0.05)。 结论: 1.本实验发现的两例错义突变,仅存在于AVSD患者中,在对照组中不存在,提示GATA4的基因突变可能与AVSD发病相关。 2.合并21-三体综合征与非合并21-三体综合征的AVSD患者GATA4检出的突变率无明显差异。 3.GATA4基因在AVSD患者中突变率低,提示AVSD可能是一个多基因的遗传性疾病。 4.GATA4基因P36A点突变(点突变概率P=0.00)可能对GATA4蛋白质功能造成严重影响。而GATA4基因S377G点突变(点突变概率P=0.63)对GATA4蛋白质的功能影响不明显。 收起
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