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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 本研究采用培养方法和非培养方法(PCR-DGGE技术)对毛竹根部内生细菌和根际细菌多样性进行了研究。 以天然林毛竹为样品,利用LB和KB两种培养基分离毛竹可培养根际细菌、根面细菌和根部内生细菌,结果表明毛竹根际细菌种群数量最高,其次为根面细... 展开 本研究采用培养方法和非培养方法(PCR-DGGE技术)对毛竹根部内生细菌和根际细菌多样性进行了研究。 以天然林毛竹为样品,利用LB和KB两种培养基分离毛竹可培养根际细菌、根面细菌和根部内生细菌,结果表明毛竹根际细菌种群数量最高,其次为根面细菌和根部内生细菌。根据细菌菌落形态特征不同共分离获得186株细菌,经16SrDNA序列分析,92株根际细菌分为Firmicutes(66.3%)、Actinobacteria(18.5%)和Proteobacteria(15.2%)三个分类单元,与34个已知细菌的序列同源性高于97%;54株根面细菌分为Firmicutes(70.4%)、Actinobacteria(24.1%)和Proteobacteria(5.5%)三个分类单元,与23个已知细菌的序列同源性高于97%;40株根部内生细菌分为Firmicutes(67.5%)、Actinobacteria(22.5%)和Proteobacteria(10.0%)三个分类单元,与16个已知种的序列同源性高于97%。天然林毛竹根面细菌和根部内生细菌中均含有Gammaproteobacteria,所占比例分别为13.0%和32.5%;而毛竹根际细菌中没有分离到这一类别的细菌。天然林毛竹根际细菌、根面细菌和根部内生细菌的优势菌属分别为Bacillus(42.4%)、Bacillus(44.4%)和Burkholderia(35.0%)。 以天然林和人工林毛竹为样品,采用非培养方法(PCR-DGGE技术)研究毛竹根际细菌和根部内生细菌多样性,结果表明天然林毛竹根际细菌多样性最高,其次为人工林毛竹根际细菌和天然林毛竹根部内生细菌,人工林毛竹根部内生细菌多样性最低。天然林、人工林毛竹根际细菌和根部内生细菌均包括Proteobacteria、Acidobacteria和Actinobacteria3个分类单元,各分类单元所占比例分别为:天然林毛竹根际细菌,58.8%、11.8%、29.4%;天然林毛竹根部内生细菌,66.6%、16.7%、16.7%;人工林毛竹根际细菌,63.3%、9.1%、27.3%;人工林毛竹根部内生细菌,76.9%、15.4%、7.7%。天然林毛竹根际细菌和根部内生细菌的优势菌属分别为Terriglobus(8.8%)和Microbacterium(22.8%),而人工林毛竹根际细菌和根部内生细菌的优势菌属分别为Microbacterium(17.3%)和Pelomonas(11.5%)。此外,天然林、人工林毛竹根际和根内细菌中存在着一些共有的细菌种类,也存在着一些各自特有的细菌种类。DGGE电泳回收条带中,51.9%条带的序列与GenBank中不可培养细菌的序列相似性最高,表明天然林和人工林毛竹根际、根内均具有大量的未培养细菌资源。 利用传统培养方法和非培养方法(DGGE技术)研究天然林毛竹根际细菌和根部内生细菌,两种方法得到的细菌多样性信息存在显著差异。培养方法得到的毛竹根际细菌和根部内生细菌属于Proteobacteria,Actinobacteria和Firmicutes三个分类单元;而非培养方法得到的毛竹根际细菌和根部内生细菌属于Proteobacteria、Actinobacteria和Acidobacteria三个分类单元。培养方法得到的毛竹根际细菌和根部内生细菌的优势菌属分别为Bacillus(42.4%)和Burkholderia(35.0%),而非培养方法得到的毛竹根际细菌和根部内生细菌的优势菌属分别为Terriglobus(8.8%)和Microbacterium(22.8%)。但培养方法和非培养方法均得到毛竹根际细菌Microbacteriumsp.(所占比例分别为1.1%,5.5%)和根部内生细菌Pseudomonassp.(所占比例分别为17.5%,8.5%)、Pantoeasp.(所占比例分别为2.5%,6.9%)。结合两种方法能够得到更加全面准确的细菌多样性信息。 收起
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