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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 最近,混合人群越来越受到进化遗传研究和医学研究的青睐。由于欧亚大陆接壤的便利性,欧亚大陆的人群在历史发展过程中不断发生着密切的文化、商业和技术交流。在这些交流活动过程中,我们还不十分清楚是否伴随着人类基因层面的交流,尤其对于西北欧... 展开 最近,混合人群越来越受到进化遗传研究和医学研究的青睐。由于欧亚大陆接壤的便利性,欧亚大陆的人群在历史发展过程中不断发生着密切的文化、商业和技术交流。在这些交流活动过程中,我们还不十分清楚是否伴随着人类基因层面的交流,尤其对于西北欧和东亚的人群而言。在本课题中,我们基于遍布欧洲、中亚和东亚的31个群体样本,以及人类全基因组高密度的单核苷酸多态性位点数据,首次对欧亚群体间的基因交流进行了综合系统的分析评估。我们发现,对于本课题中分析的大部分人类群体而言,均存在着不同程度的欧亚之间的基因混合,其中甚至包括一些我们通常认为是比较纯种的人群,比如东亚的汉族、日本人,和西北欧的一些欧洲人。接下来,我们利用两种不同的统计方法,针对这些欧亚混合群体,对他们的混合程度进行了量化估计。同时,基于混合人群基因组所表现出来的混合连锁不平衡性,我们对每个混合群体进行了混合时间上的估计。结果显示,大部分人群混合事件,发生在过去的2000年到250年间。并且,我们发现人群混合和人群地域的相关性,即中亚地区混合程度高,在20%-60%之间;西欧和东亚人群的混合程度低,在1%-10%之间。我们的研究丰富了人们对欧亚地区人群的迁徙和混合历史的认知,增进了对这些地区人群结构和基因多样性的进化机制的理解,这在今后的医学研究中,对疾病基因定位的研究有着重要启示。 尽管在人类群体形成过程中,伴随着不断的、复杂的迁徙和基因混合,而即便是大洲内部的人群在遗传结构上也始终存在着差异,比如欧洲人群群体内部和东亚人群群体内部。之前已有工作系统分析了汉族群体内部的遗传亚结构的存在,即北方汉族和南方汉族有着不同的遗传结构。汉族是一个全球最大的群体,占有人类总数的20%,而且越来越多的复杂疾病的关联性分析在汉族群体中展开。我们知道,关联分析是研究复杂疾病遗传影响因素并建立“表型-基因型”联系的重要手段,基于人群样本设计的关联研究,尤其是基于“病例-对照”设计的关联研究,经常面临的一个困难是人群遗传结构或群体分层作为一种严重的混杂因素导致的假阳性结果。在该项研究中,我们通过对5540位汉族个体的全基因组大概一百万个单核苷酸多态性位点的分析和筛选,使人们在以后的关联性分析中,能够对汉族群体遗传亚结构进行方便的鉴定和控制。基于对全因组数据的分析,我们的结果首先可以清楚显示出汉族群体的遗传亚结构的存在。然后,我们通过严格筛选,建立起一套可以高度识别汉族人群遗传结构、同时又方便使用的150个DNA祖先信息标记(AlMs)。我们对这套AIMs在模拟的复杂疾病关联性分析中的表现进行了评估。结果显示,这套AIMs在汉族群体的全基因组关联性分析和候选基因关联性分析中,可以高效地鉴定和控制群体遗传分离,显著降低分析中的假阳性,这对今后在汉族人群中从事关联分析的研究具有实际应用价值。我们建议在今后的关联分析研究中,通过对这套位点的基因分型,直接依据DNA信息对样本的遗传结构进行识别、客观分类和筛选,这是关联分析合理实验设计的前提;同时可以有效的矫正样本的遗传分层在分析过程中造成的假阳性,这是保证关联分析结果可靠性的必要条件。 收起
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