摘要: 本研究采用PCR-SSCP和DNA测序技术，检测了南阳牛、秦川牛、郏县红牛、晋南牛、安格斯牛和中国荷斯坦牛6个群体共655个个体的LEPR基因和ZAG基因的遗传变异，分析了其遗传结构和遗传多样性，并对南阳牛、秦川牛和郏县红牛3个群体在上述基因座位的多态性... 展开 本研究采用PCR-SSCP和DNA测序技术，检测了南阳牛、秦川牛、郏县红牛、晋南牛、安格斯牛和中国荷斯坦牛6个群体共655个个体的LEPR基因和ZAG基因的遗传变异，分析了其遗传结构和遗传多样性，并对南阳牛、秦川牛和郏县红牛3个群体在上述基因座位的多态性与生长性状进行了关联分析，以检验这些基因的多态对黄牛生长发育的遗传效应，以期发现对重要经济性状具有显著效应的遗传标记，为中国黄牛的高效选育和分子标记数据库的建立、种质资源保存与利用提供遗传学依据。本研究获得了以下结果： 1.6个黄牛品种LEPR基因多态性分析共检测了LEPR基因的6个基因座L1-L6，包含了外显子2～外显子7，在LEPR基因的6个基因座中，仅在L3基因座发现多态性，在L1、L2、L4-L6基因座没有发现多态性。在南阳牛、秦川牛、郏县红牛、晋南牛、安格斯牛5个品种的L3基因座首次发现5个SNP(NC_007301:g.26767T＞C，26805C＞T，27050A＞G，27063G＞A和27079G＞A)，这5个SNP完全连锁，前2个SNP在内含子3上，后3个SNP位于外显子4上，其中27050A＞G和27079G＞A突变分别导致LEPR蛋白197His＞Arg和207Asp＞Asn氨基酸突变。在中国荷斯坦牛中没有发现多态。卡方检验显示，郏县红牛处于Hardy-Weinberg非平衡状态，而其余5个品种处于平衡状态。南阳牛、秦川牛、郏县红牛、晋南牛、安格斯牛和中国荷斯坦牛6个群体遗传多态指数Ne/PIC/He分别为1.56/0.29/0.36，1.83/0.35/0.45，1.82/0.35/0.45，1.68/0.32/0.41，1.82/0.35/0.45，1.00/0.00/0.00。基因型分布的卡方独立性检验显示，中国荷斯坦牛与地方黄牛和安格斯牛差异极显著(P＜0.01)。 2.LEPR基因多态性与南阳牛、秦川牛和郏县红牛生长性状的关联分析在黄牛中，LEPR基因的L3基因座发现AA、AB、BB三种基因型。在南阳牛群体中，AA型个体6月龄体重、平均日增重显著大于BB型个体(P＜0.05)；AA型个体6月龄体高、体斜长显著大于AB型和BB型个体(P＜0.05或P＜0.01)，AA型和AB型个体6月龄胸围显著大于BB型个体(P＜0.05)。AA型个体12月龄体高、体斜长显著大于AB型和BB型个体(P＜0.05或P＜0.01)；AA型和AB型个体12月龄胸围显著大于BB型个体(P＜0.05或P＜0.01)。在郏县红牛群体中，AA型个体胸围、坐骨端宽显著大于AB型个体(P＜0.05)。在秦川牛中没有发现与基因座多态显著相关的性状。 3.6个黄牛品种ZAG基因多态性分析对ZAG基因共检测了Z1、Z2、z3和Z4四个基因座，除Z2基因座外，其他3个基因座都发现了多态性。在黄牛中，首次检测到6个SNP(NC_007326:g115T＞C，3257G＞A，4013G＞A，4027C＞T，4032T＞C和4120C＞T)，全部都位于编码区，其中115C＞T突变导致了17位Ser突变为Pro，3257A＞G突变导致了189位Arg突变为Lys，4013A＞G突变导致了233位Gly突变为Glu，4027T＞C突变导致了238位Arg突变为TrP，4120T＞C突变导致了269位Pro突变为Ser。在中国荷斯坦牛中只在Z1基因座发现多态。南阳牛、秦川牛、郏县红牛、晋南牛、安格斯牛和中国荷斯坦牛6个群体Z1基因座遗传多态指数Ne/PIC/He分别为1.41/0.25/0.29，1.48/0.27/0.32，1.47/0.28/0.32，1.34/0.22/0.26，1.48/0.27/0.32，1.36/0.23/0.27；Z3基因座遗传多态指数Ne/PIC/He分别为1.25/0.18/0.20，1.06/0.06/0.06，1.05/0.04/0.05，1.03/0.04/0.03，1.14/0.11/0.12，1.00/0.00/0.00；Z4基因座遗传多态指数Ne/PIC/He分别为1.52/0.30/0.34，1.47/0.28/0.32，1.48/0.29/0.32，1.39/0.27/0.29，1.27/0.17/0.18，1.00/0.00/0.00。Z1和Z4基因座在大部分群体处于中度多态，而Z3基因座所有群体都处于低度多态。基因型分布的卡方独立性检验显示，在Z3和Z4基因座中国荷斯坦牛与地方黄牛和安格斯牛差异极显著(P＜0.05或P＜0.01)4.ZAG基因多态性与南阳牛、秦川牛和郏县红牛生长性状的关联分析在ZAG基因的Z1和Z3基因座各检测到AA和AB两种基因型，在Z4基因座检测到AA、AB、AC三种基因型。经最小二乘分析，Z1和Z3多态基因座对南阳牛、郏县红牛和秦川牛的生长发育性状没有显著影响，而ZAG基因的Z4多态基因座对南阳牛18月龄的坐骨端宽有显著影响，AC型个体显著大于AB型个体(P＜0.05)；郏县红牛AC型个体体斜长、胸围和体重显著大于AA、AB型个体(P＜0.05或P＜0.01)；Z4基因座对秦川牛的生长发育性状没有显著影响(P＞0.05)。 收起