摘要: 在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT).NUPTs在植物染色体包括性染色体的演化过程中可能具有重要的作用,但目前该方面的研究比较少.本研究以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方... 展开 在植物基因组中,叶绿体DNA(cpDNA)序列可以向核基因组转移成为核质体DNA(NUPT).NUPTs在植物染色体包括性染色体的演化过程中可能具有重要的作用,但目前该方面的研究比较少.本研究以雌雄异株植物石刁柏(Asparagus officinalis)为材料,采用生物信息学方法对其核基因组NUPTs进行注释及分析,并选取叶绿体基因组反向重复区(IR)两个片段进行染色体定位分析.结果表明:石刁柏核基因组中共有2,239个NUPTs序列的插入,总长度为565,970bp,占核基因组的0.047％.不同染色体上插入的NUPTs数量存在较大差异,Y染色体上的NUPTs数量、密度及总长度均高于其他染色体,表明NUPTs在石刁柏Y染色体上具有更多的累积.石刁柏叶绿体基因组中的IR、SSC和LSC区均能够向核基因组转移,但IR区序列转移频率更高.另外,对两个IR区的叶绿体序列进行荧光原位杂交,其中AocpIR1主要分布在所有染色体的着丝粒部位,而AocpIR2特异分布在Y染色体上.本研究为深入理解石刁柏基因组的结构及其性染色体的演化奠定了坚实的基础. 收起