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国家工程技术图书馆
2022年11月29日
摘要: 环状RNA(circRNA)是一类没有游离末端的共价封闭的长链非编码RNA,其通过3'下游序列与5'上游序列“末端”连接,形成环形结构,由于其特殊的结构从而不易被核糖核酸外切酶切割,从而保持较高的稳定性。环状RNA在生物进程中起着重要的调节作用,在植物... 展开 环状RNA(circRNA)是一类没有游离末端的共价封闭的长链非编码RNA,其通过3'下游序列与5'上游序列“末端”连接,形成环形结构,由于其特殊的结构从而不易被核糖核酸外切酶切割,从而保持较高的稳定性。环状RNA在生物进程中起着重要的调节作用,在植物中环状RNA的研究还十分匮乏。 本研究利用水稻四个环状RNAs(Os02circ25329,Os06circ02797,Os03circ00204,Os05circ02465)敲除突变体,通过对突变体农艺性状分析、非生物胁迫、亲本/侧翼基因表达及转录组分析,初步分析了这四个水稻环状RNAs基因的生物学功能。主要研究内容及结果如下: 1.不含载体且纯合突变材料鉴定显示:Os02circ25329获得-578bp/-578bp(pZJP053-03-03、pZJP053-27-01)和-584bp/-584bp(pZJP053-29-16)两种基因型材料;Os06circ02797获得基因型为-328bp/-328bp(pZJP054-07-01-21)和-332bp/-332bp(pZJP054-32-03)两种基因型材料;Os03circ00204获得-684bp/-684bp(pZJP055-76-04)和-661bp/-661bp(pZJP055-78-01)两种基因型材料;Os05circ02465获得-843bp/-843bp(pZJP057-23-06)和-799,△1bp/-799,△1bp(pZJP055-78-04)两种基因型材料。 2.农艺性状分析结果显示:Os02circ25329、Os06circ02797、Os03circ00204、Os05circ02465四个环状RNAs突变体粒长、粒宽和千粒重与WT都无明显差异。 3.非生物胁迫处理结果表明:Os02circ25329、Os06circ02797和Os03circ00204突变体种子萌发中对盐敏感,Os05circ02465突变体种子萌发中耐盐,四个环状RNAs突变体在盐、Cu2+、干旱(PEG)胁迫下均与WT表现一致。 4.亲本/侧翼基因表达分析结果表明:Os02circ25329与Os06circ02797敲除不影响亲本基因正常表达,Os03circ00204定向敲除后左侧基因表达量显著升高,Os05circ02465敲除不影响侧翼基因的正常表达。 5.转录组分析显示:Os02circ25329影响70个基因和4个miRNA的差异表达,Os06circ02797影响135个基因和15个miRNA的差异表达,Os03circ00204影响98个基因和7个miRNA的差异表达Os05circ02465影响54个基因和2个miRNA的差异表达。 收起
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