摘要: 植物整个生长发育过程要经历多次发育阶段的转换。高等开花植物进入成年期，能够感受外界环境刺激接受诱导，从成花感受态进入相对稳定的成花决定态，该过程被称为成花诱导。成花诱导受外界环境和内在因素共同调节，确保植物在适宜的外界环境，较好的... 展开 植物整个生长发育过程要经历多次发育阶段的转换。高等开花植物进入成年期，能够感受外界环境刺激接受诱导，从成花感受态进入相对稳定的成花决定态，该过程被称为成花诱导。成花诱导受外界环境和内在因素共同调节，确保植物在适宜的外界环境，较好的自我生长状态下顺利开花，成功繁衍后代。对植物开花调控的研究，最早可以追溯到1865年Julius Sachs提出花激素概念。近30年，利用分子遗传学手段，在模式植物拟南芥、水稻中鉴定了大量开花时间调控基因，并建立了以转录因子为关键节点的调控网络。 大豆是重要的经济作物，是食品、饲料、生物质能源的重要来源。作为短日照开花植物，大豆的开花时期和产量与种植区域密切相关。目前为止，通过正向遗传学手段已经定位到E1-E9、J等多个大豆开花QTL位点，其中E1和J基因编码转录因子，在开花过程中起中心作用。由于大豆生育期长、基因组复杂（经历了两次全基因组加倍）、并且遗传转化困难，正向遗传学研究周期长，每次只能鉴定一个到几个遗传位点及基因的功能，所以利用传统手段在短时间内无法全面揭示大豆开花过程的转录调控网络。 真核生物基因表达活动复杂但又有条不紊，是生命活动的基础。反式作用因子和顺式作用元件是基因表达调控过程中的主要参与者;染色质结构的开放状态为转录因子招募RNA聚合酶Ⅱ提供了前提条件。新一代平行测序有效提高了DNA序列检测效率并降低了成本，由此衍生的染色质免疫共沉淀结合测序(ChIP-seq)、转录组测序(RNA-seq)和DNA酶Ⅰ敏感位点测序(DNase-seq)等技术，使得在基因组水平研究转录调控网络成为可能。 由于遗传转化困难、缺乏转录因子的抗体等限制，难以利用ChIP-seq技术在大豆中鉴定转录因子的结合位点。本研究面向这一挑战，利用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术与染色质开放区域测序技术(ATAC-seq)结合的策略，尝试建立大豆开花的转录调控网络。本研究初步建立了大豆DAP-seq和ATAC-seq的方法，获得了41个大豆开花过程关键转录因子的顺反组(cistrome)数据。分析了这些转录因子在基因组上结合位点的特征。利用RNA-seq技术获得了大豆由营养生长向生殖生长过程转变时，第一片三出复叶中转录活动的动态变化。利用ATAC-seq初步比较了转变过程前后染色质开放状态的变化。最终整合顺反组、转录组数据，初步搭建大豆开花的转录调控网络，为在基因组水平研究大豆开花诱导过程中转录的规律做了有益的尝试。 收起