摘要: 提高纤维产量、改良纤维品质一直是棉花育种的重要目标。发掘重要性状优异基因等位变异并开发其功能标记对于重要性状分子标记辅助育种具有重要意义。前人研究表明，将来自陆地棉的蔗糖合酶基因GhSuSA1和肌动蛋白解聚因子基因GhADF1分别转化到棉花中，... 展开 提高纤维产量、改良纤维品质一直是棉花育种的重要目标。发掘重要性状优异基因等位变异并开发其功能标记对于重要性状分子标记辅助育种具有重要意义。前人研究表明，将来自陆地棉的蔗糖合酶基因GhSuSA1和肌动蛋白解聚因子基因GhADF1分别转化到棉花中，转基因棉花的纤维品质较野生型明显提高。为此，本研究针对这两个基因，以纤维品质一般的陆地棉中棉所8号（Gossypium hirsutum，CCRI8）和优质海岛棉品种Pima90-53（G barbadense）为材料，扩增其基因组序列，测序并比对等位基因的序列差异，据此设计标记引物，寻找在陆海间具有多态性的分子标记，结合本课题组前期利用[(中棉所8号×Pima90-53)×中棉所8号]BC1群体构建的连锁图谱和群体的纤维品质数据，进行纤维品质QTL的定位，以期为棉花纤维品质分子改良提供重要的功能标记。获得主要结果如下: 1.将SuSA1的ORF序列与二倍体亚洲棉（Garboreum）和雷蒙德氏棉(G.raimondii)的A、D基因组数据库进行BLAST比对，获得SuSA1的A基因组序列和D基因组序列，并定位于二倍体Ca7和Cd8上。依据D基因组的SuSA1序列设计基因组引物，在中棉所8号和Pima90-53基因组中PCR扩增SuSA1，在中棉所8号中扩增出2种基因型，分别为来自A基因组的gGhSuSA1-1和来自D基因组的gGhSuSA1-2;在Pima90-53中也扩增出2种基因型，分别为来自A基因组的gGbSuSA1-1和来自D基因组的gGbSuSA1-2。依据SuSA1-1在陆海品种间存在的SNP序列差异设计引物S1-1-11，结果引物在海岛棉Pima90-53中能扩增出条带，大小为214bp，而在陆地棉中棉所8号中无扩增条带;依据SuSA1-2在陆海品种的InDel序列差异设计引物S1-2-1，结果在中棉所8号和Pima90-53中分别扩增出260bp和248bp的目的条带。 2.将ADF1的ORF与二倍体亚洲棉和雷蒙德氏棉的A、D基因组数据库进行BLAST比对，获得ADF1的A基因组序列和D基因组序列，并定位于二倍体Ca5和Cd13上。依据D基因组的ADF1序列设计基因组引物，在中棉所8号和Pima90-53基因组中PCR扩增ADF1，在中棉所8号中扩增出2种基因型，分别为来自A基因组的gGhADF1-1和来自D基因组的gGhADF1-2;在Pima90-53中也扩增出2种基因型，分别为来自A基因组的gGbADF1-1和来自D基因组的gGbADF1-2。依据ADF1-1在陆海品种的InDel序列差异设计引物A11-1，在中棉所8号和Pima90-53中扩增出的条带大小分别为200bp、229bp;依据ADF1-2在陆海品种间的SNP序列差异设计引物A12-1，在Pima90-53中扩增条带大小为143bp，但在中棉所8号中无扩增条带。 3.使用M apmaker3.0软件，将本研究获得的功能标记整合到课题组前期基于[(中棉所8号×Pima90-53)×中棉所8号]BC1群体获得的遗传连锁图谱中，发现S1-1-11、S1-2-1分别位于连锁群A8(c8)、D8(c24)，A11-1、A12-1标记分别位于连锁群A5(c5)和D13(c18)。应用完备区间作图法，基于课题组前期获得的BC1群体纤维品质数据对纤维品质QTL进行定位，当LOD值为5.0时，在A8 S1-1-11处存在马克隆值的QTL，可解释表型变异的11.1％;当LOD值为3.0时，在D8 S1-2-1处存在马克隆值的QTL，可解释表型变异的为9.7％。当LOD值为3.0时，在D13A12-1处存在纤维长度QTL，可解释表型变异的4.7％。 收起