摘要: 本论文以四川山地乌骨鸡和大恒优质肉鸡为研究对象，采用RT-PCR的方法扩增FATP4基因并对其cDNA序列和蛋白质结构进行了生物信息学的分析；运用实时荧光定量RT-PCR技术，以β-actin为内参基因，研究了四川山地乌骨鸡FATP4基因的发育性表达规律，比较了两... 展开 本论文以四川山地乌骨鸡和大恒优质肉鸡为研究对象，采用RT-PCR的方法扩增FATP4基因并对其cDNA序列和蛋白质结构进行了生物信息学的分析；运用实时荧光定量RT-PCR技术，以β-actin为内参基因，研究了四川山地乌骨鸡FATP4基因的发育性表达规律，比较了两个不同品种FATP4基因组织的表达差异。结果表明： 四川山地乌骨鸡FATP4基因CDS区长1107bp，共编码368个氨基酸，山地乌骨鸡的核酸序列与原鸡、家鼠、人、褐鼠和猩猩的同源性为67．1%，99．6%，67．2%，67．4%，66．6%和67．3%；而氨基酸序列相比分别为100%，72．8%，76．4%，75．8%和72．8%。可以看出，山地乌骨鸡的核酸序列和氨基酸序列与其它物种的同源性较高，说明已成功获得了山地乌骨鸡的FATP4序列。 经生物信息学分析，鸡FATP4是有1个很有可能的跨膜区，分别位于17-33位的跨膜蛋白，相对分子量为41．47kDa，其理论等电点pI=7．46。在糖基化位点预测的同时未发现信号肽特征，极可能不具有信号肽结构，鸡FATP4分子氨基酸序列的存在信号锚序列的概率为0．00%，存在信号肽序列的可能性为0．00%。该蛋白质多肽链有个主要的疏水区，分别位于氨基酸序列的9-37，51-66，98-115，128-145和250-278。该蛋白质的二级结构含有α螺旋（α-helix，h）34．78%，延伸主链（extendedstrand）16．03%，随机卷曲（random coil）49．18%。 对四川山地乌骨鸡FATP4 mRNA组织表达差异的研究显示：8w、10w和12wFATP4分别在皮脂、肝脏和脑组织中表达量较高。FATP4：表达量在胸肌，腿肌，皮脂和腹脂中最高值分别在8w，8w，4w和12w。FATP4：表达量在肝脏，心脏和脑中最高值分别8w，6w和8w。肝脏为FATP4基因的优势表达组织。 本研究发现FATP4基因的表达量随时间的变化是不同的。其腿肌，胸肌，肝脏和脑中的表达量在8w达到最高：皮脂和腹脂中的表达量分别在4w和12w达到最高。FATP4基因在腿肌、胸肌、肝脏和脑中的优势表达时间点是8w；在皮脂、腹脂和心脏中的优势表达时间点分别是4w、12w和6w。鸡腹脂的沉积一般随着生长而增加，但本研究发现FATP4基因在腹脂中的表达趋势都是增加-减少-增加的趋势。本研究发现FATP4在山地乌骨鸡和S01系中的表达差异虽不显著，但山地乌骨鸡中的表达量却高于SO1。 收起